Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gm28047Q3US59 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gm28047Q3US59 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gm28047Q3US59 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gm28047Q3US59 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gm28047Q3US59 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gm28047Q3US59 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gm28047Q3US59 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Gm28047Q3US59 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gm28047Q3US59 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Gm28047Q3US59 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gm28047Q3US59 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gm28047Q3US59 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gm28047Q3US59 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gm28047Q3US59 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gm28047Q3US59 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gm28047Q3US59 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gm28047Q3US59 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Gm28047Q3US59 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Gm28047Q3US59 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gm28047Q3US59 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gm28047Q3US59 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Gm28047Q3US59 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gm28047Q3US59 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gm28047Q3US59 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gm28047Q3US59 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gm28047Q3US59 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gm28047Q3US59 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gm28047Q3US59 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gm28047Q3US59 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gm28047Q3US59 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gm28047Q3US59 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gm28047Q3US59 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gm28047Q3US59 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gm28047Q3US59 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gm28047Q3US59 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gm28047Q3US59 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm28047Q3US59 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm28047Q3US59 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Gm28047Q3US59 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm28047Q3US59 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm28047Q3US59 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm28047Q3US59 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm28047Q3US59 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gm28047Q3US59 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gm28047Q3US59 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm28047Q3US59 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm28047Q3US59 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm28047Q3US59 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Gm28047Q3US59 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gm28047Q3US59 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gm28047Q3US59 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gm28047Q3US59 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gm28047Q3US59 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gm28047Q3US59 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gm28047Q3US59 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gm28047Q3US59 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gm28047Q3US59 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gm28047Q3US59 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gm28047Q3US59 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gm28047Q3US59 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gm28047Q3US59 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gm28047Q3US59 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gm28047Q3US59 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gm28047Q3US59 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gm28047Q3US59 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gm28047Q3US59 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gm28047Q3US59 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gm28047Q3US59 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gm28047Q3US59 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gm28047Q3US59 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gm28047Q3US59 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gm28047Q3US59 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gm28047Q3US59 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gm28047Q3US59 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gm28047Q3US59 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gm28047Q3US59 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gm28047Q3US59 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gm28047Q3US59 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gm28047Q3US59 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gm28047Q3US59 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Gm28047Q3US59 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gm28047Q3US59 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gm28047Q3US59 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gm28047Q3US59 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gm28047Q3US59 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gm28047Q3US59 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gm28047Q3US59 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gm28047Q3US59 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gm28047Q3US59 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Gm28047Q3US59 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gm28047Q3US59 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gm28047Q3US59 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gm28047Q3US59 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm28047Q3US59 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm28047Q3US59 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm28047Q3US59 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gm28047Q3US59 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gm28047Q3US59 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gm28047Q3US59 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms