Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fam193bQ3U2K0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fam193bQ3U2K0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fam193bQ3U2K0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fam193bQ3U2K0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Fam193bQ3U2K0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fam193bQ3U2K0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fam193bQ3U2K0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fam193bQ3U2K0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fam193bQ3U2K0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fam193bQ3U2K0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam193bQ3U2K0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fam193bQ3U2K0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fam193bQ3U2K0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fam193bQ3U2K0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fam193bQ3U2K0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fam193bQ3U2K0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Fam193bQ3U2K0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fam193bQ3U2K0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fam193bQ3U2K0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fam193bQ3U2K0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Fam193bQ3U2K0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fam193bQ3U2K0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fam193bQ3U2K0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fam193bQ3U2K0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fam193bQ3U2K0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fam193bQ3U2K0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fam193bQ3U2K0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Fam193bQ3U2K0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fam193bQ3U2K0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Fam193bQ3U2K0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fam193bQ3U2K0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fam193bQ3U2K0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam193bQ3U2K0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam193bQ3U2K0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam193bQ3U2K0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fam193bQ3U2K0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fam193bQ3U2K0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fam193bQ3U2K0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fam193bQ3U2K0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Fam193bQ3U2K0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fam193bQ3U2K0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fam193bQ3U2K0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Fam193bQ3U2K0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam193bQ3U2K0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fam193bQ3U2K0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fam193bQ3U2K0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fam193bQ3U2K0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fam193bQ3U2K0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fam193bQ3U2K0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fam193bQ3U2K0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fam193bQ3U2K0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Fam193bQ3U2K0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fam193bQ3U2K0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fam193bQ3U2K0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fam193bQ3U2K0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fam193bQ3U2K0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fam193bQ3U2K0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fam193bQ3U2K0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Fam193bQ3U2K0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Fam193bQ3U2K0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fam193bQ3U2K0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fam193bQ3U2K0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fam193bQ3U2K0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fam193bQ3U2K0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Fam193bQ3U2K0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fam193bQ3U2K0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fam193bQ3U2K0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fam193bQ3U2K0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fam193bQ3U2K0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fam193bQ3U2K0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam193bQ3U2K0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam193bQ3U2K0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fam193bQ3U2K0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fam193bQ3U2K0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fam193bQ3U2K0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fam193bQ3U2K0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fam193bQ3U2K0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fam193bQ3U2K0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fam193bQ3U2K0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam193bQ3U2K0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fam193bQ3U2K0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fam193bQ3U2K0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fam193bQ3U2K0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fam193bQ3U2K0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Fam193bQ3U2K0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fam193bQ3U2K0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fam193bQ3U2K0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fam193bQ3U2K0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fam193bQ3U2K0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fam193bQ3U2K0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fam193bQ3U2K0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fam193bQ3U2K0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fam193bQ3U2K0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fam193bQ3U2K0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Fam193bQ3U2K0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fam193bQ3U2K0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam193bQ3U2K0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fam193bQ3U2K0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fam193bQ3U2K0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms