Protein–RNA interactions for Protein: Q3U108

Arid5a, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid5aQ3U108 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arid5aQ3U108 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Arid5aQ3U108 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Arid5aQ3U108 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Arid5aQ3U108 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Arid5aQ3U108 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Arid5aQ3U108 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arid5aQ3U108 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arid5aQ3U108 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arid5aQ3U108 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arid5aQ3U108 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arid5aQ3U108 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Arid5aQ3U108 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arid5aQ3U108 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arid5aQ3U108 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arid5aQ3U108 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arid5aQ3U108 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arid5aQ3U108 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arid5aQ3U108 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arid5aQ3U108 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arid5aQ3U108 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arid5aQ3U108 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arid5aQ3U108 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arid5aQ3U108 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arid5aQ3U108 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Arid5aQ3U108 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arid5aQ3U108 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arid5aQ3U108 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arid5aQ3U108 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arid5aQ3U108 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arid5aQ3U108 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arid5aQ3U108 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arid5aQ3U108 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arid5aQ3U108 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arid5aQ3U108 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arid5aQ3U108 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arid5aQ3U108 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arid5aQ3U108 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arid5aQ3U108 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arid5aQ3U108 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arid5aQ3U108 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arid5aQ3U108 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arid5aQ3U108 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arid5aQ3U108 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Arid5aQ3U108 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Arid5aQ3U108 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Arid5aQ3U108 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arid5aQ3U108 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arid5aQ3U108 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arid5aQ3U108 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arid5aQ3U108 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arid5aQ3U108 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arid5aQ3U108 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Arid5aQ3U108 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arid5aQ3U108 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Arid5aQ3U108 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Arid5aQ3U108 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Arid5aQ3U108 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arid5aQ3U108 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Arid5aQ3U108 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Arid5aQ3U108 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arid5aQ3U108 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arid5aQ3U108 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arid5aQ3U108 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arid5aQ3U108 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arid5aQ3U108 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arid5aQ3U108 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arid5aQ3U108 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arid5aQ3U108 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arid5aQ3U108 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arid5aQ3U108 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms