Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srsf6Q3TWW8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srsf6Q3TWW8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srsf6Q3TWW8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Srsf6Q3TWW8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Srsf6Q3TWW8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srsf6Q3TWW8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srsf6Q3TWW8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Srsf6Q3TWW8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srsf6Q3TWW8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srsf6Q3TWW8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srsf6Q3TWW8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srsf6Q3TWW8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Srsf6Q3TWW8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Srsf6Q3TWW8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Srsf6Q3TWW8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srsf6Q3TWW8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srsf6Q3TWW8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srsf6Q3TWW8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Srsf6Q3TWW8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Srsf6Q3TWW8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srsf6Q3TWW8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srsf6Q3TWW8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srsf6Q3TWW8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srsf6Q3TWW8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Srsf6Q3TWW8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srsf6Q3TWW8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srsf6Q3TWW8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srsf6Q3TWW8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srsf6Q3TWW8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srsf6Q3TWW8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srsf6Q3TWW8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srsf6Q3TWW8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srsf6Q3TWW8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srsf6Q3TWW8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srsf6Q3TWW8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srsf6Q3TWW8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srsf6Q3TWW8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srsf6Q3TWW8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Srsf6Q3TWW8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srsf6Q3TWW8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srsf6Q3TWW8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srsf6Q3TWW8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srsf6Q3TWW8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srsf6Q3TWW8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Srsf6Q3TWW8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srsf6Q3TWW8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srsf6Q3TWW8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srsf6Q3TWW8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srsf6Q3TWW8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srsf6Q3TWW8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srsf6Q3TWW8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srsf6Q3TWW8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srsf6Q3TWW8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srsf6Q3TWW8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srsf6Q3TWW8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srsf6Q3TWW8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Srsf6Q3TWW8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srsf6Q3TWW8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srsf6Q3TWW8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srsf6Q3TWW8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srsf6Q3TWW8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srsf6Q3TWW8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srsf6Q3TWW8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srsf6Q3TWW8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srsf6Q3TWW8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srsf6Q3TWW8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srsf6Q3TWW8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srsf6Q3TWW8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srsf6Q3TWW8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srsf6Q3TWW8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srsf6Q3TWW8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srsf6Q3TWW8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srsf6Q3TWW8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srsf6Q3TWW8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srsf6Q3TWW8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srsf6Q3TWW8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srsf6Q3TWW8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srsf6Q3TWW8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srsf6Q3TWW8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srsf6Q3TWW8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Srsf6Q3TWW8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srsf6Q3TWW8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srsf6Q3TWW8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srsf6Q3TWW8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srsf6Q3TWW8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srsf6Q3TWW8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srsf6Q3TWW8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Srsf6Q3TWW8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srsf6Q3TWW8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srsf6Q3TWW8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srsf6Q3TWW8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srsf6Q3TWW8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srsf6Q3TWW8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srsf6Q3TWW8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srsf6Q3TWW8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srsf6Q3TWW8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srsf6Q3TWW8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srsf6Q3TWW8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms