Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccndbp1Q3TVC7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccndbp1Q3TVC7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccndbp1Q3TVC7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccndbp1Q3TVC7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccndbp1Q3TVC7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccndbp1Q3TVC7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccndbp1Q3TVC7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccndbp1Q3TVC7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccndbp1Q3TVC7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccndbp1Q3TVC7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccndbp1Q3TVC7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccndbp1Q3TVC7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccndbp1Q3TVC7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccndbp1Q3TVC7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccndbp1Q3TVC7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccndbp1Q3TVC7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccndbp1Q3TVC7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccndbp1Q3TVC7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccndbp1Q3TVC7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccndbp1Q3TVC7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccndbp1Q3TVC7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccndbp1Q3TVC7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccndbp1Q3TVC7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccndbp1Q3TVC7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccndbp1Q3TVC7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccndbp1Q3TVC7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccndbp1Q3TVC7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccndbp1Q3TVC7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccndbp1Q3TVC7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccndbp1Q3TVC7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccndbp1Q3TVC7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccndbp1Q3TVC7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccndbp1Q3TVC7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccndbp1Q3TVC7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccndbp1Q3TVC7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccndbp1Q3TVC7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccndbp1Q3TVC7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccndbp1Q3TVC7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccndbp1Q3TVC7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccndbp1Q3TVC7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccndbp1Q3TVC7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccndbp1Q3TVC7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccndbp1Q3TVC7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccndbp1Q3TVC7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccndbp1Q3TVC7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccndbp1Q3TVC7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccndbp1Q3TVC7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccndbp1Q3TVC7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccndbp1Q3TVC7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccndbp1Q3TVC7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccndbp1Q3TVC7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccndbp1Q3TVC7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccndbp1Q3TVC7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccndbp1Q3TVC7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccndbp1Q3TVC7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccndbp1Q3TVC7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccndbp1Q3TVC7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccndbp1Q3TVC7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccndbp1Q3TVC7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccndbp1Q3TVC7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccndbp1Q3TVC7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccndbp1Q3TVC7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccndbp1Q3TVC7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccndbp1Q3TVC7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccndbp1Q3TVC7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccndbp1Q3TVC7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccndbp1Q3TVC7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccndbp1Q3TVC7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccndbp1Q3TVC7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccndbp1Q3TVC7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
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