Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP8

Tmem38a, Trimeric intracellular cation channel type A, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem38aQ3TMP8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem38aQ3TMP8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem38aQ3TMP8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem38aQ3TMP8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem38aQ3TMP8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem38aQ3TMP8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem38aQ3TMP8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem38aQ3TMP8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem38aQ3TMP8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem38aQ3TMP8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmem38aQ3TMP8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem38aQ3TMP8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem38aQ3TMP8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmem38aQ3TMP8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem38aQ3TMP8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem38aQ3TMP8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem38aQ3TMP8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem38aQ3TMP8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem38aQ3TMP8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem38aQ3TMP8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem38aQ3TMP8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem38aQ3TMP8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem38aQ3TMP8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem38aQ3TMP8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem38aQ3TMP8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem38aQ3TMP8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem38aQ3TMP8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem38aQ3TMP8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem38aQ3TMP8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem38aQ3TMP8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem38aQ3TMP8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem38aQ3TMP8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem38aQ3TMP8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem38aQ3TMP8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem38aQ3TMP8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem38aQ3TMP8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem38aQ3TMP8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem38aQ3TMP8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem38aQ3TMP8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem38aQ3TMP8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem38aQ3TMP8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem38aQ3TMP8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem38aQ3TMP8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmem38aQ3TMP8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmem38aQ3TMP8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmem38aQ3TMP8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmem38aQ3TMP8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmem38aQ3TMP8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem38aQ3TMP8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem38aQ3TMP8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem38aQ3TMP8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem38aQ3TMP8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem38aQ3TMP8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmem38aQ3TMP8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem38aQ3TMP8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem38aQ3TMP8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem38aQ3TMP8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem38aQ3TMP8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem38aQ3TMP8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem38aQ3TMP8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem38aQ3TMP8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem38aQ3TMP8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem38aQ3TMP8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem38aQ3TMP8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem38aQ3TMP8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem38aQ3TMP8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem38aQ3TMP8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem38aQ3TMP8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem38aQ3TMP8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem38aQ3TMP8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem38aQ3TMP8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem38aQ3TMP8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem38aQ3TMP8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem38aQ3TMP8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem38aQ3TMP8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tmem38aQ3TMP8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem38aQ3TMP8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem38aQ3TMP8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem38aQ3TMP8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem38aQ3TMP8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem38aQ3TMP8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem38aQ3TMP8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem38aQ3TMP8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem38aQ3TMP8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem38aQ3TMP8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem38aQ3TMP8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem38aQ3TMP8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem38aQ3TMP8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem38aQ3TMP8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem38aQ3TMP8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem38aQ3TMP8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem38aQ3TMP8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem38aQ3TMP8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem38aQ3TMP8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem38aQ3TMP8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem38aQ3TMP8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem38aQ3TMP8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem38aQ3TMP8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem38aQ3TMP8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem38aQ3TMP8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.7 ms