Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gtf2f1Q3THK3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gtf2f1Q3THK3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gtf2f1Q3THK3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gtf2f1Q3THK3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gtf2f1Q3THK3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gtf2f1Q3THK3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gtf2f1Q3THK3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gtf2f1Q3THK3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gtf2f1Q3THK3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gtf2f1Q3THK3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gtf2f1Q3THK3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gtf2f1Q3THK3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gtf2f1Q3THK3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gtf2f1Q3THK3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gtf2f1Q3THK3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gtf2f1Q3THK3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gtf2f1Q3THK3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gtf2f1Q3THK3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gtf2f1Q3THK3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gtf2f1Q3THK3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gtf2f1Q3THK3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gtf2f1Q3THK3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Gtf2f1Q3THK3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gtf2f1Q3THK3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gtf2f1Q3THK3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Gtf2f1Q3THK3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gtf2f1Q3THK3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gtf2f1Q3THK3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gtf2f1Q3THK3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gtf2f1Q3THK3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Gtf2f1Q3THK3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gtf2f1Q3THK3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gtf2f1Q3THK3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Gtf2f1Q3THK3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gtf2f1Q3THK3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gtf2f1Q3THK3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gtf2f1Q3THK3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gtf2f1Q3THK3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gtf2f1Q3THK3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gtf2f1Q3THK3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Gtf2f1Q3THK3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Gtf2f1Q3THK3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gtf2f1Q3THK3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gtf2f1Q3THK3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gtf2f1Q3THK3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gtf2f1Q3THK3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gtf2f1Q3THK3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gtf2f1Q3THK3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gtf2f1Q3THK3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Gtf2f1Q3THK3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gtf2f1Q3THK3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gtf2f1Q3THK3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gtf2f1Q3THK3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gtf2f1Q3THK3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gtf2f1Q3THK3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gtf2f1Q3THK3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gtf2f1Q3THK3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gtf2f1Q3THK3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gtf2f1Q3THK3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gtf2f1Q3THK3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gtf2f1Q3THK3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gtf2f1Q3THK3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gtf2f1Q3THK3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gtf2f1Q3THK3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gtf2f1Q3THK3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Gtf2f1Q3THK3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gtf2f1Q3THK3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gtf2f1Q3THK3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gtf2f1Q3THK3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gtf2f1Q3THK3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gtf2f1Q3THK3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gtf2f1Q3THK3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gtf2f1Q3THK3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gtf2f1Q3THK3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Gtf2f1Q3THK3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Gtf2f1Q3THK3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gtf2f1Q3THK3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gtf2f1Q3THK3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gtf2f1Q3THK3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gtf2f1Q3THK3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gtf2f1Q3THK3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gtf2f1Q3THK3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gtf2f1Q3THK3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gtf2f1Q3THK3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Gtf2f1Q3THK3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gtf2f1Q3THK3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gtf2f1Q3THK3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gtf2f1Q3THK3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gtf2f1Q3THK3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gtf2f1Q3THK3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gtf2f1Q3THK3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gtf2f1Q3THK3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gtf2f1Q3THK3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gtf2f1Q3THK3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gtf2f1Q3THK3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gtf2f1Q3THK3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms