Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEA8

Hp1bp3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hp1bp3Q3TEA8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hp1bp3Q3TEA8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hp1bp3Q3TEA8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hp1bp3Q3TEA8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hp1bp3Q3TEA8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hp1bp3Q3TEA8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hp1bp3Q3TEA8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hp1bp3Q3TEA8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hp1bp3Q3TEA8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hp1bp3Q3TEA8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hp1bp3Q3TEA8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hp1bp3Q3TEA8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hp1bp3Q3TEA8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hp1bp3Q3TEA8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hp1bp3Q3TEA8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hp1bp3Q3TEA8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hp1bp3Q3TEA8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hp1bp3Q3TEA8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hp1bp3Q3TEA8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hp1bp3Q3TEA8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hp1bp3Q3TEA8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hp1bp3Q3TEA8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hp1bp3Q3TEA8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hp1bp3Q3TEA8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hp1bp3Q3TEA8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hp1bp3Q3TEA8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hp1bp3Q3TEA8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hp1bp3Q3TEA8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hp1bp3Q3TEA8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hp1bp3Q3TEA8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hp1bp3Q3TEA8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hp1bp3Q3TEA8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hp1bp3Q3TEA8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hp1bp3Q3TEA8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hp1bp3Q3TEA8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hp1bp3Q3TEA8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hp1bp3Q3TEA8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hp1bp3Q3TEA8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hp1bp3Q3TEA8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hp1bp3Q3TEA8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hp1bp3Q3TEA8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hp1bp3Q3TEA8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hp1bp3Q3TEA8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hp1bp3Q3TEA8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hp1bp3Q3TEA8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hp1bp3Q3TEA8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hp1bp3Q3TEA8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hp1bp3Q3TEA8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hp1bp3Q3TEA8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hp1bp3Q3TEA8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hp1bp3Q3TEA8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hp1bp3Q3TEA8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hp1bp3Q3TEA8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hp1bp3Q3TEA8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hp1bp3Q3TEA8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hp1bp3Q3TEA8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hp1bp3Q3TEA8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hp1bp3Q3TEA8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hp1bp3Q3TEA8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hp1bp3Q3TEA8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hp1bp3Q3TEA8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hp1bp3Q3TEA8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hp1bp3Q3TEA8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hp1bp3Q3TEA8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hp1bp3Q3TEA8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hp1bp3Q3TEA8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hp1bp3Q3TEA8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hp1bp3Q3TEA8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hp1bp3Q3TEA8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hp1bp3Q3TEA8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hp1bp3Q3TEA8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hp1bp3Q3TEA8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hp1bp3Q3TEA8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hp1bp3Q3TEA8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hp1bp3Q3TEA8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hp1bp3Q3TEA8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hp1bp3Q3TEA8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hp1bp3Q3TEA8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hp1bp3Q3TEA8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hp1bp3Q3TEA8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hp1bp3Q3TEA8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hp1bp3Q3TEA8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hp1bp3Q3TEA8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hp1bp3Q3TEA8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hp1bp3Q3TEA8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hp1bp3Q3TEA8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hp1bp3Q3TEA8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hp1bp3Q3TEA8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hp1bp3Q3TEA8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hp1bp3Q3TEA8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hp1bp3Q3TEA8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hp1bp3Q3TEA8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hp1bp3Q3TEA8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hp1bp3Q3TEA8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hp1bp3Q3TEA8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hp1bp3Q3TEA8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hp1bp3Q3TEA8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hp1bp3Q3TEA8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hp1bp3Q3TEA8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hp1bp3Q3TEA8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms