Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR2

Pdss1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1Q33DR2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdss1Q33DR2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdss1Q33DR2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdss1Q33DR2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdss1Q33DR2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdss1Q33DR2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdss1Q33DR2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdss1Q33DR2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdss1Q33DR2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdss1Q33DR2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdss1Q33DR2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdss1Q33DR2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdss1Q33DR2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdss1Q33DR2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdss1Q33DR2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdss1Q33DR2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdss1Q33DR2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdss1Q33DR2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdss1Q33DR2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdss1Q33DR2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdss1Q33DR2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdss1Q33DR2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdss1Q33DR2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdss1Q33DR2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdss1Q33DR2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdss1Q33DR2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdss1Q33DR2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdss1Q33DR2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdss1Q33DR2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdss1Q33DR2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdss1Q33DR2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdss1Q33DR2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdss1Q33DR2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdss1Q33DR2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdss1Q33DR2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdss1Q33DR2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdss1Q33DR2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdss1Q33DR2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdss1Q33DR2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdss1Q33DR2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdss1Q33DR2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdss1Q33DR2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdss1Q33DR2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdss1Q33DR2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdss1Q33DR2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdss1Q33DR2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdss1Q33DR2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdss1Q33DR2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdss1Q33DR2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdss1Q33DR2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdss1Q33DR2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdss1Q33DR2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdss1Q33DR2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdss1Q33DR2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdss1Q33DR2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdss1Q33DR2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdss1Q33DR2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdss1Q33DR2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdss1Q33DR2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdss1Q33DR2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdss1Q33DR2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdss1Q33DR2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdss1Q33DR2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdss1Q33DR2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdss1Q33DR2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdss1Q33DR2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdss1Q33DR2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdss1Q33DR2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdss1Q33DR2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdss1Q33DR2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdss1Q33DR2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdss1Q33DR2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdss1Q33DR2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdss1Q33DR2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdss1Q33DR2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdss1Q33DR2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdss1Q33DR2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdss1Q33DR2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdss1Q33DR2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdss1Q33DR2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdss1Q33DR2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pdss1Q33DR2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdss1Q33DR2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdss1Q33DR2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdss1Q33DR2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdss1Q33DR2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdss1Q33DR2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdss1Q33DR2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdss1Q33DR2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdss1Q33DR2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdss1Q33DR2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdss1Q33DR2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdss1Q33DR2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdss1Q33DR2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdss1Q33DR2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdss1Q33DR2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdss1Q33DR2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdss1Q33DR2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdss1Q33DR2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdss1Q33DR2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms