Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Samd11Q1RNF8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Samd11Q1RNF8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Samd11Q1RNF8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Samd11Q1RNF8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Samd11Q1RNF8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Samd11Q1RNF8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Samd11Q1RNF8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Samd11Q1RNF8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Samd11Q1RNF8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Samd11Q1RNF8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Samd11Q1RNF8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Samd11Q1RNF8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Samd11Q1RNF8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Samd11Q1RNF8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Samd11Q1RNF8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Samd11Q1RNF8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Samd11Q1RNF8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Samd11Q1RNF8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Samd11Q1RNF8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Samd11Q1RNF8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Samd11Q1RNF8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Samd11Q1RNF8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Samd11Q1RNF8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Samd11Q1RNF8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Samd11Q1RNF8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Samd11Q1RNF8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Samd11Q1RNF8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Samd11Q1RNF8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Samd11Q1RNF8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Samd11Q1RNF8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Samd11Q1RNF8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Samd11Q1RNF8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Samd11Q1RNF8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Samd11Q1RNF8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Samd11Q1RNF8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Samd11Q1RNF8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Samd11Q1RNF8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Samd11Q1RNF8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Samd11Q1RNF8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Samd11Q1RNF8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Samd11Q1RNF8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Samd11Q1RNF8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Samd11Q1RNF8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Samd11Q1RNF8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Samd11Q1RNF8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Samd11Q1RNF8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Samd11Q1RNF8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Samd11Q1RNF8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Samd11Q1RNF8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Samd11Q1RNF8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Samd11Q1RNF8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Samd11Q1RNF8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Samd11Q1RNF8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Samd11Q1RNF8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Samd11Q1RNF8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Samd11Q1RNF8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Samd11Q1RNF8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Samd11Q1RNF8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Samd11Q1RNF8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Samd11Q1RNF8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Samd11Q1RNF8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Samd11Q1RNF8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Samd11Q1RNF8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Samd11Q1RNF8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Samd11Q1RNF8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Samd11Q1RNF8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Samd11Q1RNF8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Samd11Q1RNF8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Samd11Q1RNF8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Samd11Q1RNF8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Samd11Q1RNF8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Samd11Q1RNF8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Samd11Q1RNF8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Samd11Q1RNF8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Samd11Q1RNF8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Samd11Q1RNF8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Samd11Q1RNF8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Samd11Q1RNF8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Samd11Q1RNF8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Samd11Q1RNF8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Samd11Q1RNF8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Samd11Q1RNF8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Samd11Q1RNF8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Samd11Q1RNF8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Samd11Q1RNF8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Samd11Q1RNF8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Samd11Q1RNF8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Samd11Q1RNF8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Samd11Q1RNF8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Samd11Q1RNF8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Samd11Q1RNF8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Samd11Q1RNF8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Samd11Q1RNF8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Samd11Q1RNF8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Samd11Q1RNF8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Samd11Q1RNF8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Samd11Q1RNF8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Samd11Q1RNF8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Samd11Q1RNF8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
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