Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Sox12Q04890 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Sox12Q04890 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Sox12Q04890 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Sox12Q04890 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Sox12Q04890 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Sox12Q04890 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Sox12Q04890 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Sox12Q04890 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Sox12Q04890 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Sox12Q04890 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Sox12Q04890 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Sox12Q04890 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Sox12Q04890 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Sox12Q04890 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Sox12Q04890 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Sox12Q04890 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Sox12Q04890 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Sox12Q04890 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Sox12Q04890 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Sox12Q04890 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Sox12Q04890 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Sox12Q04890 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Sox12Q04890 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Sox12Q04890 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Sox12Q04890 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Sox12Q04890 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Sox12Q04890 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Sox12Q04890 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Sox12Q04890 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Sox12Q04890 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Sox12Q04890 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Sox12Q04890 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Sox12Q04890 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Sox12Q04890 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Sox12Q04890 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Sox12Q04890 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Sox12Q04890 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Sox12Q04890 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Sox12Q04890 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Sox12Q04890 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Sox12Q04890 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Sox12Q04890 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Sox12Q04890 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Sox12Q04890 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Sox12Q04890 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Sox12Q04890 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Sox12Q04890 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Sox12Q04890 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Sox12Q04890 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Sox12Q04890 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Sox12Q04890 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Sox12Q04890 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Sox12Q04890 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Sox12Q04890 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Sox12Q04890 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Sox12Q04890 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Sox12Q04890 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Sox12Q04890 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Sox12Q04890 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Sox12Q04890 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Sox12Q04890 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Sox12Q04890 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Sox12Q04890 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Sox12Q04890 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Sox12Q04890 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Sox12Q04890 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Sox12Q04890 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Sox12Q04890 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Sox12Q04890 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Sox12Q04890 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Sox12Q04890 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Sox12Q04890 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Sox12Q04890 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Sox12Q04890 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Sox12Q04890 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Sox12Q04890 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Sox12Q04890 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Sox12Q04890 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Sox12Q04890 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Sox12Q04890 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Sox12Q04890 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Sox12Q04890 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Sox12Q04890 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Sox12Q04890 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Sox12Q04890 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Sox12Q04890 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Sox12Q04890 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Sox12Q04890 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Sox12Q04890 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Sox12Q04890 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Sox12Q04890 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Sox12Q04890 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Sox12Q04890 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Sox12Q04890 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Sox12Q04890 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Sox12Q04890 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Sox12Q04890 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Sox12Q04890 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Sox12Q04890 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms