Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pfdn6Q03958 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pfdn6Q03958 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pfdn6Q03958 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pfdn6Q03958 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pfdn6Q03958 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pfdn6Q03958 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pfdn6Q03958 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pfdn6Q03958 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pfdn6Q03958 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pfdn6Q03958 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pfdn6Q03958 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pfdn6Q03958 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pfdn6Q03958 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pfdn6Q03958 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pfdn6Q03958 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pfdn6Q03958 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pfdn6Q03958 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pfdn6Q03958 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pfdn6Q03958 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pfdn6Q03958 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pfdn6Q03958 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pfdn6Q03958 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pfdn6Q03958 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pfdn6Q03958 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pfdn6Q03958 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pfdn6Q03958 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Pfdn6Q03958 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pfdn6Q03958 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pfdn6Q03958 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pfdn6Q03958 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pfdn6Q03958 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pfdn6Q03958 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pfdn6Q03958 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pfdn6Q03958 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pfdn6Q03958 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pfdn6Q03958 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pfdn6Q03958 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pfdn6Q03958 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pfdn6Q03958 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pfdn6Q03958 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pfdn6Q03958 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pfdn6Q03958 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pfdn6Q03958 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pfdn6Q03958 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pfdn6Q03958 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pfdn6Q03958 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pfdn6Q03958 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pfdn6Q03958 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Pfdn6Q03958 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pfdn6Q03958 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pfdn6Q03958 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pfdn6Q03958 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pfdn6Q03958 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pfdn6Q03958 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pfdn6Q03958 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pfdn6Q03958 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pfdn6Q03958 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pfdn6Q03958 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pfdn6Q03958 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pfdn6Q03958 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pfdn6Q03958 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pfdn6Q03958 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pfdn6Q03958 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pfdn6Q03958 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pfdn6Q03958 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pfdn6Q03958 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pfdn6Q03958 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pfdn6Q03958 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Pfdn6Q03958 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pfdn6Q03958 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pfdn6Q03958 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pfdn6Q03958 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pfdn6Q03958 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pfdn6Q03958 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pfdn6Q03958 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pfdn6Q03958 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pfdn6Q03958 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pfdn6Q03958 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pfdn6Q03958 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pfdn6Q03958 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pfdn6Q03958 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pfdn6Q03958 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pfdn6Q03958 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pfdn6Q03958 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pfdn6Q03958 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pfdn6Q03958 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pfdn6Q03958 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pfdn6Q03958 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pfdn6Q03958 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pfdn6Q03958 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pfdn6Q03958 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pfdn6Q03958 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pfdn6Q03958 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Pfdn6Q03958 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pfdn6Q03958 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pfdn6Q03958 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pfdn6Q03958 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pfdn6Q03958 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pfdn6Q03958 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms