Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gjb4Q02738 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gjb4Q02738 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gjb4Q02738 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gjb4Q02738 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gjb4Q02738 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gjb4Q02738 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gjb4Q02738 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gjb4Q02738 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gjb4Q02738 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gjb4Q02738 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gjb4Q02738 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gjb4Q02738 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gjb4Q02738 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gjb4Q02738 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gjb4Q02738 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gjb4Q02738 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gjb4Q02738 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gjb4Q02738 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gjb4Q02738 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Gjb4Q02738 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gjb4Q02738 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gjb4Q02738 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gjb4Q02738 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gjb4Q02738 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gjb4Q02738 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gjb4Q02738 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Gjb4Q02738 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gjb4Q02738 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gjb4Q02738 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gjb4Q02738 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gjb4Q02738 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Gjb4Q02738 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gjb4Q02738 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gjb4Q02738 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gjb4Q02738 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gjb4Q02738 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gjb4Q02738 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gjb4Q02738 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gjb4Q02738 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Gjb4Q02738 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gjb4Q02738 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gjb4Q02738 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gjb4Q02738 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gjb4Q02738 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gjb4Q02738 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gjb4Q02738 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gjb4Q02738 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gjb4Q02738 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gjb4Q02738 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gjb4Q02738 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gjb4Q02738 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gjb4Q02738 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gjb4Q02738 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gjb4Q02738 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gjb4Q02738 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gjb4Q02738 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gjb4Q02738 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gjb4Q02738 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gjb4Q02738 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gjb4Q02738 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gjb4Q02738 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Gjb4Q02738 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gjb4Q02738 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gjb4Q02738 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gjb4Q02738 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gjb4Q02738 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gjb4Q02738 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Gjb4Q02738 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gjb4Q02738 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Gjb4Q02738 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gjb4Q02738 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Gjb4Q02738 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gjb4Q02738 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gjb4Q02738 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gjb4Q02738 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gjb4Q02738 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gjb4Q02738 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gjb4Q02738 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gjb4Q02738 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gjb4Q02738 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gjb4Q02738 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gjb4Q02738 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gjb4Q02738 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gjb4Q02738 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gjb4Q02738 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gjb4Q02738 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gjb4Q02738 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gjb4Q02738 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gjb4Q02738 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gjb4Q02738 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gjb4Q02738 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gjb4Q02738 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Gjb4Q02738 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gjb4Q02738 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gjb4Q02738 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gjb4Q02738 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gjb4Q02738 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gjb4Q02738 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gjb4Q02738 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms