Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ascl1Q02067 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ascl1Q02067 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ascl1Q02067 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ascl1Q02067 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ascl1Q02067 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ascl1Q02067 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ascl1Q02067 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ascl1Q02067 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ascl1Q02067 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ascl1Q02067 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ascl1Q02067 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ascl1Q02067 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ascl1Q02067 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ascl1Q02067 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ascl1Q02067 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ascl1Q02067 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ascl1Q02067 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ascl1Q02067 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ascl1Q02067 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ascl1Q02067 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ascl1Q02067 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ascl1Q02067 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ascl1Q02067 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ascl1Q02067 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ascl1Q02067 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ascl1Q02067 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ascl1Q02067 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ascl1Q02067 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ascl1Q02067 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ascl1Q02067 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ascl1Q02067 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ascl1Q02067 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ascl1Q02067 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ascl1Q02067 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ascl1Q02067 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ascl1Q02067 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ascl1Q02067 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ascl1Q02067 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ascl1Q02067 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ascl1Q02067 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ascl1Q02067 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ascl1Q02067 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ascl1Q02067 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ascl1Q02067 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ascl1Q02067 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ascl1Q02067 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ascl1Q02067 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ascl1Q02067 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ascl1Q02067 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ascl1Q02067 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ascl1Q02067 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ascl1Q02067 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ascl1Q02067 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ascl1Q02067 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ascl1Q02067 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ascl1Q02067 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ascl1Q02067 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ascl1Q02067 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ascl1Q02067 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ascl1Q02067 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ascl1Q02067 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ascl1Q02067 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ascl1Q02067 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ascl1Q02067 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ascl1Q02067 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ascl1Q02067 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ascl1Q02067 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ascl1Q02067 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ascl1Q02067 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ascl1Q02067 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ascl1Q02067 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ascl1Q02067 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ascl1Q02067 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ascl1Q02067 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ascl1Q02067 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ascl1Q02067 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ascl1Q02067 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ascl1Q02067 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ascl1Q02067 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ascl1Q02067 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ascl1Q02067 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ascl1Q02067 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ascl1Q02067 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ascl1Q02067 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ascl1Q02067 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ascl1Q02067 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ascl1Q02067 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ascl1Q02067 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ascl1Q02067 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ascl1Q02067 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ascl1Q02067 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ascl1Q02067 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ascl1Q02067 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ascl1Q02067 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ascl1Q02067 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ascl1Q02067 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ascl1Q02067 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ascl1Q02067 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ascl1Q02067 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms