Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Grin2cQ01098 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Grin2cQ01098 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Grin2cQ01098 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Grin2cQ01098 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Grin2cQ01098 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Grin2cQ01098 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Grin2cQ01098 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Grin2cQ01098 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Grin2cQ01098 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Grin2cQ01098 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Grin2cQ01098 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Grin2cQ01098 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Grin2cQ01098 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Grin2cQ01098 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Grin2cQ01098 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Grin2cQ01098 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Grin2cQ01098 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Grin2cQ01098 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Grin2cQ01098 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Grin2cQ01098 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Grin2cQ01098 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Grin2cQ01098 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2cQ01098 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Grin2cQ01098 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Grin2cQ01098 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Grin2cQ01098 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Grin2cQ01098 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Grin2cQ01098 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Grin2cQ01098 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Grin2cQ01098 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grin2cQ01098 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grin2cQ01098 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2cQ01098 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Grin2cQ01098 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grin2cQ01098 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grin2cQ01098 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Grin2cQ01098 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grin2cQ01098 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grin2cQ01098 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grin2cQ01098 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Grin2cQ01098 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Grin2cQ01098 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Grin2cQ01098 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Grin2cQ01098 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Grin2cQ01098 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Grin2cQ01098 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Grin2cQ01098 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Grin2cQ01098 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Grin2cQ01098 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Grin2cQ01098 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Grin2cQ01098 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Grin2cQ01098 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Grin2cQ01098 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Grin2cQ01098 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Grin2cQ01098 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Grin2cQ01098 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Grin2cQ01098 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2cQ01098 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Grin2cQ01098 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Grin2cQ01098 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Grin2cQ01098 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Grin2cQ01098 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Grin2cQ01098 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Grin2cQ01098 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Grin2cQ01098 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Grin2cQ01098 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Grin2cQ01098 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Grin2cQ01098 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Grin2cQ01098 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Grin2cQ01098 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Grin2cQ01098 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Grin2cQ01098 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Grin2cQ01098 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Grin2cQ01098 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Grin2cQ01098 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Grin2cQ01098 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Grin2cQ01098 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Grin2cQ01098 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Grin2cQ01098 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Grin2cQ01098 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Grin2cQ01098 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Grin2cQ01098 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Grin2cQ01098 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Grin2cQ01098 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Grin2cQ01098 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Grin2cQ01098 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Grin2cQ01098 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Grin2cQ01098 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Grin2cQ01098 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Grin2cQ01098 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Grin2cQ01098 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Grin2cQ01098 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Grin2cQ01098 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Grin2cQ01098 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Grin2cQ01098 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Grin2cQ01098 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Grin2cQ01098 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Grin2cQ01098 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Grin2cQ01098 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms