Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cds1P98191 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cds1P98191 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cds1P98191 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cds1P98191 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cds1P98191 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cds1P98191 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cds1P98191 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cds1P98191 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cds1P98191 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cds1P98191 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cds1P98191 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cds1P98191 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cds1P98191 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cds1P98191 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cds1P98191 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cds1P98191 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cds1P98191 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cds1P98191 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cds1P98191 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cds1P98191 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cds1P98191 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cds1P98191 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cds1P98191 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cds1P98191 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cds1P98191 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cds1P98191 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cds1P98191 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cds1P98191 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cds1P98191 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cds1P98191 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cds1P98191 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cds1P98191 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cds1P98191 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cds1P98191 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cds1P98191 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cds1P98191 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cds1P98191 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cds1P98191 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cds1P98191 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cds1P98191 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cds1P98191 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cds1P98191 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cds1P98191 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cds1P98191 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cds1P98191 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cds1P98191 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cds1P98191 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cds1P98191 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cds1P98191 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cds1P98191 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cds1P98191 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cds1P98191 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cds1P98191 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cds1P98191 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cds1P98191 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cds1P98191 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cds1P98191 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cds1P98191 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cds1P98191 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cds1P98191 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cds1P98191 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cds1P98191 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cds1P98191 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cds1P98191 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cds1P98191 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cds1P98191 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cds1P98191 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cds1P98191 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cds1P98191 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cds1P98191 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cds1P98191 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cds1P98191 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cds1P98191 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cds1P98191 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cds1P98191 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cds1P98191 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cds1P98191 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cds1P98191 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cds1P98191 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cds1P98191 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cds1P98191 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cds1P98191 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cds1P98191 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cds1P98191 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cds1P98191 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cds1P98191 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cds1P98191 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cds1P98191 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cds1P98191 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cds1P98191 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cds1P98191 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cds1P98191 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cds1P98191 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cds1P98191 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cds1P98191 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cds1P98191 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cds1P98191 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cds1P98191 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cds1P98191 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms