Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ErfP70459 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ErfP70459 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ErfP70459 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ErfP70459 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ErfP70459 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ErfP70459 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ErfP70459 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ErfP70459 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ErfP70459 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ErfP70459 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ErfP70459 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ErfP70459 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ErfP70459 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ErfP70459 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ErfP70459 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ErfP70459 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ErfP70459 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ErfP70459 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ErfP70459 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ErfP70459 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ErfP70459 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ErfP70459 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ErfP70459 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ErfP70459 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ErfP70459 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ErfP70459 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ErfP70459 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ErfP70459 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ErfP70459 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ErfP70459 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ErfP70459 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ErfP70459 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ErfP70459 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ErfP70459 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ErfP70459 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ErfP70459 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ErfP70459 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ErfP70459 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ErfP70459 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ErfP70459 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ErfP70459 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ErfP70459 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ErfP70459 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ErfP70459 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ErfP70459 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ErfP70459 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ErfP70459 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ErfP70459 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ErfP70459 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ErfP70459 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ErfP70459 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ErfP70459 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ErfP70459 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ErfP70459 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ErfP70459 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ErfP70459 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ErfP70459 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ErfP70459 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ErfP70459 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ErfP70459 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ErfP70459 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ErfP70459 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ErfP70459 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ErfP70459 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ErfP70459 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ErfP70459 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ErfP70459 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ErfP70459 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ErfP70459 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ErfP70459 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ErfP70459 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ErfP70459 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ErfP70459 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ErfP70459 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ErfP70459 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ErfP70459 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ErfP70459 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ErfP70459 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ErfP70459 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ErfP70459 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ErfP70459 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ErfP70459 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ErfP70459 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ErfP70459 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ErfP70459 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ErfP70459 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ErfP70459 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ErfP70459 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ErfP70459 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ErfP70459 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ErfP70459 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ErfP70459 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ErfP70459 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ErfP70459 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ErfP70459 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ErfP70459 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ErfP70459 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ErfP70459 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ErfP70459 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms