Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vamp7P70280 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vamp7P70280 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vamp7P70280 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vamp7P70280 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vamp7P70280 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vamp7P70280 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Vamp7P70280 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vamp7P70280 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vamp7P70280 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vamp7P70280 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Vamp7P70280 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Vamp7P70280 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vamp7P70280 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vamp7P70280 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vamp7P70280 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vamp7P70280 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vamp7P70280 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vamp7P70280 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vamp7P70280 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vamp7P70280 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vamp7P70280 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vamp7P70280 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Vamp7P70280 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Vamp7P70280 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Vamp7P70280 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vamp7P70280 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vamp7P70280 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vamp7P70280 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vamp7P70280 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vamp7P70280 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vamp7P70280 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vamp7P70280 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vamp7P70280 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vamp7P70280 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vamp7P70280 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vamp7P70280 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vamp7P70280 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vamp7P70280 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vamp7P70280 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vamp7P70280 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vamp7P70280 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Vamp7P70280 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vamp7P70280 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Vamp7P70280 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vamp7P70280 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vamp7P70280 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vamp7P70280 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vamp7P70280 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vamp7P70280 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vamp7P70280 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vamp7P70280 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vamp7P70280 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vamp7P70280 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vamp7P70280 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vamp7P70280 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vamp7P70280 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vamp7P70280 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vamp7P70280 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vamp7P70280 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vamp7P70280 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vamp7P70280 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Vamp7P70280 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vamp7P70280 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vamp7P70280 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vamp7P70280 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vamp7P70280 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vamp7P70280 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vamp7P70280 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vamp7P70280 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vamp7P70280 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vamp7P70280 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vamp7P70280 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vamp7P70280 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vamp7P70280 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vamp7P70280 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Vamp7P70280 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vamp7P70280 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vamp7P70280 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Vamp7P70280 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Vamp7P70280 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vamp7P70280 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vamp7P70280 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vamp7P70280 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vamp7P70280 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vamp7P70280 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vamp7P70280 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vamp7P70280 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vamp7P70280 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vamp7P70280 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Vamp7P70280 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Vamp7P70280 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vamp7P70280 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vamp7P70280 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
Vamp7P70280 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vamp7P70280 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Vamp7P70280 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vamp7P70280 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vamp7P70280 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Vamp7P70280 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms