Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Stra8P70278 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Stra8P70278 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Stra8P70278 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Stra8P70278 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Stra8P70278 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Stra8P70278 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Stra8P70278 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Stra8P70278 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Stra8P70278 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Stra8P70278 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Stra8P70278 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Stra8P70278 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Stra8P70278 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Stra8P70278 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Stra8P70278 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Stra8P70278 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Stra8P70278 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Stra8P70278 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Stra8P70278 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Stra8P70278 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Stra8P70278 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Stra8P70278 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Stra8P70278 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Stra8P70278 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Stra8P70278 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Stra8P70278 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Stra8P70278 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Stra8P70278 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Stra8P70278 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Stra8P70278 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Stra8P70278 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Stra8P70278 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Stra8P70278 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Stra8P70278 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Stra8P70278 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Stra8P70278 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Stra8P70278 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Stra8P70278 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Stra8P70278 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Stra8P70278 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Stra8P70278 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Stra8P70278 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Stra8P70278 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Stra8P70278 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Stra8P70278 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Stra8P70278 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Stra8P70278 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Stra8P70278 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Stra8P70278 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Stra8P70278 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Stra8P70278 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Stra8P70278 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Stra8P70278 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Stra8P70278 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Stra8P70278 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Stra8P70278 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Stra8P70278 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Stra8P70278 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Stra8P70278 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Stra8P70278 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Stra8P70278 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Stra8P70278 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Stra8P70278 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Stra8P70278 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Stra8P70278 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Stra8P70278 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Stra8P70278 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Stra8P70278 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Stra8P70278 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Stra8P70278 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Stra8P70278 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Stra8P70278 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
Stra8P70278 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Stra8P70278 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Stra8P70278 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Stra8P70278 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Stra8P70278 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Stra8P70278 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Stra8P70278 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Stra8P70278 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Stra8P70278 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Stra8P70278 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Stra8P70278 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Stra8P70278 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Stra8P70278 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Stra8P70278 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Stra8P70278 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Stra8P70278 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Stra8P70278 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Stra8P70278 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Stra8P70278 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Stra8P70278 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Stra8P70278 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Stra8P70278 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Stra8P70278 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Stra8P70278 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Stra8P70278 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Stra8P70278 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Stra8P70278 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms