Protein–RNA interactions for Protein: P70166

Cpeb1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpeb1P70166 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpeb1P70166 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpeb1P70166 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpeb1P70166 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpeb1P70166 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpeb1P70166 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpeb1P70166 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpeb1P70166 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpeb1P70166 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpeb1P70166 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cpeb1P70166 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cpeb1P70166 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpeb1P70166 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpeb1P70166 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpeb1P70166 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpeb1P70166 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpeb1P70166 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpeb1P70166 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpeb1P70166 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpeb1P70166 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpeb1P70166 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpeb1P70166 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpeb1P70166 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpeb1P70166 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpeb1P70166 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpeb1P70166 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpeb1P70166 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpeb1P70166 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpeb1P70166 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpeb1P70166 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpeb1P70166 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpeb1P70166 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpeb1P70166 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpeb1P70166 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpeb1P70166 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpeb1P70166 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpeb1P70166 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpeb1P70166 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpeb1P70166 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpeb1P70166 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpeb1P70166 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpeb1P70166 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpeb1P70166 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpeb1P70166 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpeb1P70166 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpeb1P70166 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpeb1P70166 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpeb1P70166 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpeb1P70166 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpeb1P70166 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpeb1P70166 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpeb1P70166 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpeb1P70166 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpeb1P70166 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpeb1P70166 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpeb1P70166 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpeb1P70166 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpeb1P70166 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpeb1P70166 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpeb1P70166 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpeb1P70166 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpeb1P70166 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpeb1P70166 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpeb1P70166 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpeb1P70166 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpeb1P70166 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpeb1P70166 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpeb1P70166 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpeb1P70166 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpeb1P70166 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpeb1P70166 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpeb1P70166 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpeb1P70166 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpeb1P70166 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpeb1P70166 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpeb1P70166 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpeb1P70166 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpeb1P70166 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpeb1P70166 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpeb1P70166 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpeb1P70166 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpeb1P70166 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpeb1P70166 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpeb1P70166 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpeb1P70166 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpeb1P70166 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpeb1P70166 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpeb1P70166 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpeb1P70166 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpeb1P70166 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpeb1P70166 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpeb1P70166 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpeb1P70166 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpeb1P70166 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpeb1P70166 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpeb1P70166 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpeb1P70166 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpeb1P70166 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpeb1P70166 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpeb1P70166 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms