Protein–RNA interactions for Protein: P63147

Ube2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2bP63147 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2bP63147 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2bP63147 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2bP63147 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2bP63147 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2bP63147 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2bP63147 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2bP63147 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2bP63147 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2bP63147 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2bP63147 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2bP63147 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2bP63147 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2bP63147 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2bP63147 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2bP63147 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2bP63147 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2bP63147 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2bP63147 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2bP63147 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2bP63147 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2bP63147 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2bP63147 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2bP63147 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2bP63147 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2bP63147 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2bP63147 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2bP63147 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2bP63147 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2bP63147 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2bP63147 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2bP63147 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2bP63147 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2bP63147 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2bP63147 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2bP63147 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2bP63147 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2bP63147 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2bP63147 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2bP63147 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2bP63147 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2bP63147 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2bP63147 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2bP63147 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2bP63147 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2bP63147 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2bP63147 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2bP63147 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2bP63147 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2bP63147 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2bP63147 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2bP63147 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2bP63147 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2bP63147 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2bP63147 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2bP63147 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2bP63147 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2bP63147 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2bP63147 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2bP63147 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2bP63147 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2bP63147 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2bP63147 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2bP63147 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2bP63147 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2bP63147 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2bP63147 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2bP63147 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2bP63147 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2bP63147 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2bP63147 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2bP63147 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2bP63147 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2bP63147 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2bP63147 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2bP63147 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2bP63147 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2bP63147 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2bP63147 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2bP63147 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2bP63147 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2bP63147 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2bP63147 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2bP63147 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2bP63147 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2bP63147 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2bP63147 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2bP63147 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2bP63147 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2bP63147 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2bP63147 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2bP63147 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2bP63147 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2bP63147 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2bP63147 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2bP63147 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2bP63147 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2bP63147 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube2bP63147 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2bP63147 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms