Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rps3P62908 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rps3P62908 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rps3P62908 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rps3P62908 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rps3P62908 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rps3P62908 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rps3P62908 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rps3P62908 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rps3P62908 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rps3P62908 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rps3P62908 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rps3P62908 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rps3P62908 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rps3P62908 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rps3P62908 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rps3P62908 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rps3P62908 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rps3P62908 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rps3P62908 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rps3P62908 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rps3P62908 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rps3P62908 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rps3P62908 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rps3P62908 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rps3P62908 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rps3P62908 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rps3P62908 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rps3P62908 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rps3P62908 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rps3P62908 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rps3P62908 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rps3P62908 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rps3P62908 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps3P62908 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps3P62908 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps3P62908 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps3P62908 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps3P62908 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps3P62908 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rps3P62908 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rps3P62908 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rps3P62908 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rps3P62908 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rps3P62908 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rps3P62908 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rps3P62908 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rps3P62908 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rps3P62908 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rps3P62908 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rps3P62908 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rps3P62908 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rps3P62908 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rps3P62908 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rps3P62908 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rps3P62908 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rps3P62908 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rps3P62908 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rps3P62908 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rps3P62908 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rps3P62908 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rps3P62908 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rps3P62908 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rps3P62908 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rps3P62908 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rps3P62908 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rps3P62908 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rps3P62908 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rps3P62908 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rps3P62908 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rps3P62908 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rps3P62908 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rps3P62908 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Rps3P62908 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rps3P62908 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rps3P62908 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rps3P62908 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rps3P62908 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rps3P62908 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rps3P62908 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rps3P62908 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rps3P62908 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rps3P62908 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rps3P62908 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rps3P62908 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rps3P62908 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rps3P62908 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rps3P62908 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rps3P62908 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rps3P62908 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rps3P62908 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rps3P62908 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rps3P62908 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rps3P62908 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rps3P62908 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rps3P62908 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rps3P62908 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rps3P62908 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rps3P62908 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rps3P62908 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms