Protein–RNA interactions for Protein: P59328

Wdhd1, WD repeat and HMG-box DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdhd1P59328 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Wdhd1P59328 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Wdhd1P59328 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Wdhd1P59328 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Wdhd1P59328 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Wdhd1P59328 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Wdhd1P59328 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Wdhd1P59328 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Wdhd1P59328 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Wdhd1P59328 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Wdhd1P59328 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Wdhd1P59328 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Wdhd1P59328 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Wdhd1P59328 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Wdhd1P59328 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Wdhd1P59328 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Wdhd1P59328 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Wdhd1P59328 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Wdhd1P59328 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Wdhd1P59328 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Wdhd1P59328 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Wdhd1P59328 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Wdhd1P59328 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Wdhd1P59328 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Wdhd1P59328 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Wdhd1P59328 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Wdhd1P59328 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Wdhd1P59328 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Wdhd1P59328 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Wdhd1P59328 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Wdhd1P59328 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Wdhd1P59328 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Wdhd1P59328 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Wdhd1P59328 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Wdhd1P59328 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Wdhd1P59328 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Wdhd1P59328 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Wdhd1P59328 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Wdhd1P59328 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Wdhd1P59328 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Wdhd1P59328 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Wdhd1P59328 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Wdhd1P59328 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Wdhd1P59328 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Wdhd1P59328 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Wdhd1P59328 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Wdhd1P59328 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Wdhd1P59328 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Wdhd1P59328 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Wdhd1P59328 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Wdhd1P59328 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Wdhd1P59328 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Wdhd1P59328 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Wdhd1P59328 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Wdhd1P59328 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Wdhd1P59328 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Wdhd1P59328 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Wdhd1P59328 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Wdhd1P59328 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Wdhd1P59328 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Wdhd1P59328 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Wdhd1P59328 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Wdhd1P59328 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Wdhd1P59328 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Wdhd1P59328 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Wdhd1P59328 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Wdhd1P59328 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Wdhd1P59328 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Wdhd1P59328 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Wdhd1P59328 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Wdhd1P59328 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Wdhd1P59328 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Wdhd1P59328 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Wdhd1P59328 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Wdhd1P59328 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Wdhd1P59328 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Wdhd1P59328 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Wdhd1P59328 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Wdhd1P59328 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Wdhd1P59328 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Wdhd1P59328 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Wdhd1P59328 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Wdhd1P59328 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Wdhd1P59328 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Wdhd1P59328 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Wdhd1P59328 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Wdhd1P59328 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Wdhd1P59328 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Wdhd1P59328 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Wdhd1P59328 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Wdhd1P59328 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Wdhd1P59328 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Wdhd1P59328 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Wdhd1P59328 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Wdhd1P59328 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Wdhd1P59328 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Wdhd1P59328 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Wdhd1P59328 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Wdhd1P59328 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Wdhd1P59328 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms