Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccr4P51680 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccr4P51680 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccr4P51680 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccr4P51680 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccr4P51680 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccr4P51680 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccr4P51680 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccr4P51680 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccr4P51680 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccr4P51680 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccr4P51680 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccr4P51680 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccr4P51680 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccr4P51680 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccr4P51680 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccr4P51680 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccr4P51680 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccr4P51680 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccr4P51680 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccr4P51680 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccr4P51680 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccr4P51680 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccr4P51680 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccr4P51680 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccr4P51680 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccr4P51680 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccr4P51680 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccr4P51680 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccr4P51680 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccr4P51680 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccr4P51680 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccr4P51680 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccr4P51680 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccr4P51680 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccr4P51680 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccr4P51680 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccr4P51680 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccr4P51680 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccr4P51680 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccr4P51680 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccr4P51680 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccr4P51680 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccr4P51680 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccr4P51680 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccr4P51680 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccr4P51680 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccr4P51680 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccr4P51680 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccr4P51680 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccr4P51680 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccr4P51680 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccr4P51680 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccr4P51680 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccr4P51680 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccr4P51680 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccr4P51680 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccr4P51680 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccr4P51680 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccr4P51680 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr4P51680 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr4P51680 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr4P51680 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccr4P51680 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccr4P51680 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccr4P51680 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccr4P51680 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccr4P51680 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccr4P51680 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr4P51680 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr4P51680 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr4P51680 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccr4P51680 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccr4P51680 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccr4P51680 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccr4P51680 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccr4P51680 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccr4P51680 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccr4P51680 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccr4P51680 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccr4P51680 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccr4P51680 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccr4P51680 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccr4P51680 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccr4P51680 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccr4P51680 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccr4P51680 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccr4P51680 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccr4P51680 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccr4P51680 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccr4P51680 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccr4P51680 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccr4P51680 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccr4P51680 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccr4P51680 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccr4P51680 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccr4P51680 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccr4P51680 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccr4P51680 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccr4P51680 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms