Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Resp18P47939 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Resp18P47939 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Resp18P47939 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Resp18P47939 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Resp18P47939 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Resp18P47939 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Resp18P47939 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Resp18P47939 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Resp18P47939 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Resp18P47939 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Resp18P47939 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Resp18P47939 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Resp18P47939 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Resp18P47939 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Resp18P47939 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Resp18P47939 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Resp18P47939 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Resp18P47939 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Resp18P47939 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Resp18P47939 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Resp18P47939 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Resp18P47939 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Resp18P47939 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Resp18P47939 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Resp18P47939 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Resp18P47939 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Resp18P47939 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Resp18P47939 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Resp18P47939 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Resp18P47939 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Resp18P47939 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Resp18P47939 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Resp18P47939 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Resp18P47939 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Resp18P47939 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Resp18P47939 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Resp18P47939 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Resp18P47939 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Resp18P47939 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Resp18P47939 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Resp18P47939 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Resp18P47939 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Resp18P47939 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Resp18P47939 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Resp18P47939 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Resp18P47939 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Resp18P47939 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Resp18P47939 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Resp18P47939 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Resp18P47939 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Resp18P47939 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Resp18P47939 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Resp18P47939 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Resp18P47939 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Resp18P47939 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Resp18P47939 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Resp18P47939 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Resp18P47939 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Resp18P47939 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Resp18P47939 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Resp18P47939 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Resp18P47939 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Resp18P47939 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Resp18P47939 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Resp18P47939 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Resp18P47939 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Resp18P47939 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Resp18P47939 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Resp18P47939 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Resp18P47939 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Resp18P47939 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Resp18P47939 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Resp18P47939 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Resp18P47939 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Resp18P47939 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Resp18P47939 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Resp18P47939 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Resp18P47939 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Resp18P47939 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Resp18P47939 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Resp18P47939 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Resp18P47939 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Resp18P47939 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Resp18P47939 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Resp18P47939 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Resp18P47939 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Resp18P47939 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Resp18P47939 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Resp18P47939 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Resp18P47939 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Resp18P47939 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Resp18P47939 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Resp18P47939 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Resp18P47939 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Resp18P47939 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Resp18P47939 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Resp18P47939 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Resp18P47939 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Resp18P47939 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms