Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TfamP40630 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TfamP40630 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TfamP40630 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TfamP40630 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TfamP40630 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TfamP40630 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TfamP40630 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TfamP40630 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TfamP40630 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TfamP40630 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TfamP40630 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TfamP40630 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TfamP40630 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TfamP40630 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TfamP40630 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TfamP40630 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TfamP40630 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TfamP40630 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TfamP40630 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TfamP40630 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TfamP40630 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TfamP40630 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TfamP40630 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TfamP40630 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TfamP40630 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TfamP40630 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TfamP40630 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TfamP40630 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TfamP40630 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TfamP40630 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TfamP40630 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TfamP40630 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TfamP40630 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TfamP40630 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TfamP40630 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TfamP40630 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TfamP40630 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TfamP40630 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TfamP40630 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TfamP40630 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TfamP40630 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TfamP40630 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TfamP40630 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TfamP40630 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TfamP40630 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TfamP40630 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TfamP40630 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TfamP40630 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TfamP40630 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TfamP40630 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TfamP40630 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TfamP40630 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TfamP40630 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TfamP40630 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TfamP40630 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TfamP40630 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TfamP40630 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TfamP40630 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TfamP40630 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TfamP40630 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TfamP40630 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TfamP40630 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TfamP40630 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TfamP40630 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TfamP40630 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TfamP40630 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TfamP40630 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TfamP40630 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TfamP40630 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TfamP40630 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TfamP40630 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TfamP40630 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TfamP40630 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TfamP40630 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TfamP40630 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TfamP40630 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TfamP40630 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TfamP40630 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TfamP40630 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TfamP40630 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TfamP40630 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TfamP40630 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TfamP40630 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TfamP40630 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TfamP40630 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TfamP40630 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TfamP40630 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TfamP40630 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TfamP40630 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TfamP40630 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TfamP40630 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TfamP40630 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TfamP40630 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TfamP40630 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TfamP40630 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TfamP40630 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TfamP40630 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TfamP40630 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TfamP40630 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms