Protein–RNA interactions for Protein: P23506

Pcmt1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmt1P23506 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcmt1P23506 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcmt1P23506 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcmt1P23506 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcmt1P23506 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcmt1P23506 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcmt1P23506 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcmt1P23506 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcmt1P23506 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcmt1P23506 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcmt1P23506 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcmt1P23506 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcmt1P23506 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcmt1P23506 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcmt1P23506 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcmt1P23506 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcmt1P23506 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcmt1P23506 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcmt1P23506 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcmt1P23506 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcmt1P23506 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcmt1P23506 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcmt1P23506 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcmt1P23506 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcmt1P23506 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcmt1P23506 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcmt1P23506 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcmt1P23506 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcmt1P23506 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcmt1P23506 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcmt1P23506 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcmt1P23506 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcmt1P23506 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcmt1P23506 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcmt1P23506 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcmt1P23506 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcmt1P23506 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcmt1P23506 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcmt1P23506 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcmt1P23506 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcmt1P23506 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcmt1P23506 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcmt1P23506 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcmt1P23506 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcmt1P23506 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcmt1P23506 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcmt1P23506 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcmt1P23506 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcmt1P23506 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcmt1P23506 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcmt1P23506 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcmt1P23506 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcmt1P23506 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcmt1P23506 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcmt1P23506 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcmt1P23506 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcmt1P23506 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcmt1P23506 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcmt1P23506 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcmt1P23506 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcmt1P23506 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcmt1P23506 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcmt1P23506 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcmt1P23506 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcmt1P23506 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcmt1P23506 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcmt1P23506 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcmt1P23506 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcmt1P23506 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcmt1P23506 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcmt1P23506 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcmt1P23506 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcmt1P23506 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcmt1P23506 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcmt1P23506 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcmt1P23506 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcmt1P23506 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcmt1P23506 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcmt1P23506 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcmt1P23506 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcmt1P23506 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcmt1P23506 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcmt1P23506 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcmt1P23506 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcmt1P23506 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcmt1P23506 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcmt1P23506 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcmt1P23506 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcmt1P23506 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcmt1P23506 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcmt1P23506 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcmt1P23506 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcmt1P23506 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcmt1P23506 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcmt1P23506 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcmt1P23506 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcmt1P23506 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcmt1P23506 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcmt1P23506 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcmt1P23506 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms