Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pou5f1P20263 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pou5f1P20263 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pou5f1P20263 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pou5f1P20263 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pou5f1P20263 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pou5f1P20263 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pou5f1P20263 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pou5f1P20263 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pou5f1P20263 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pou5f1P20263 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pou5f1P20263 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pou5f1P20263 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pou5f1P20263 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pou5f1P20263 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pou5f1P20263 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pou5f1P20263 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pou5f1P20263 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pou5f1P20263 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pou5f1P20263 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pou5f1P20263 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pou5f1P20263 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pou5f1P20263 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pou5f1P20263 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pou5f1P20263 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pou5f1P20263 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pou5f1P20263 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pou5f1P20263 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pou5f1P20263 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pou5f1P20263 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pou5f1P20263 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pou5f1P20263 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pou5f1P20263 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pou5f1P20263 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pou5f1P20263 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pou5f1P20263 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pou5f1P20263 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pou5f1P20263 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pou5f1P20263 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pou5f1P20263 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pou5f1P20263 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pou5f1P20263 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pou5f1P20263 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pou5f1P20263 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pou5f1P20263 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pou5f1P20263 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pou5f1P20263 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pou5f1P20263 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pou5f1P20263 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Pou5f1P20263 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Pou5f1P20263 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pou5f1P20263 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pou5f1P20263 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pou5f1P20263 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pou5f1P20263 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pou5f1P20263 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pou5f1P20263 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Pou5f1P20263 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pou5f1P20263 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pou5f1P20263 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pou5f1P20263 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pou5f1P20263 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pou5f1P20263 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pou5f1P20263 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pou5f1P20263 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pou5f1P20263 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pou5f1P20263 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pou5f1P20263 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pou5f1P20263 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pou5f1P20263 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pou5f1P20263 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pou5f1P20263 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pou5f1P20263 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pou5f1P20263 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pou5f1P20263 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pou5f1P20263 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pou5f1P20263 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pou5f1P20263 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pou5f1P20263 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pou5f1P20263 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pou5f1P20263 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pou5f1P20263 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pou5f1P20263 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pou5f1P20263 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pou5f1P20263 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pou5f1P20263 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pou5f1P20263 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pou5f1P20263 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pou5f1P20263 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pou5f1P20263 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pou5f1P20263 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pou5f1P20263 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pou5f1P20263 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Pou5f1P20263 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Pou5f1P20263 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pou5f1P20263 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pou5f1P20263 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pou5f1P20263 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pou5f1P20263 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pou5f1P20263 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms