Protein–RNA interactions for Protein: P16043

Ghrh, Somatoliberin, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GhrhP16043 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GhrhP16043 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GhrhP16043 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GhrhP16043 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GhrhP16043 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GhrhP16043 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GhrhP16043 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GhrhP16043 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GhrhP16043 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GhrhP16043 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GhrhP16043 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GhrhP16043 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GhrhP16043 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GhrhP16043 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GhrhP16043 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GhrhP16043 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GhrhP16043 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GhrhP16043 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GhrhP16043 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GhrhP16043 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GhrhP16043 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GhrhP16043 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GhrhP16043 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GhrhP16043 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GhrhP16043 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GhrhP16043 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GhrhP16043 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GhrhP16043 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GhrhP16043 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GhrhP16043 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GhrhP16043 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GhrhP16043 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GhrhP16043 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GhrhP16043 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GhrhP16043 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GhrhP16043 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GhrhP16043 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GhrhP16043 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GhrhP16043 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GhrhP16043 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GhrhP16043 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GhrhP16043 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GhrhP16043 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GhrhP16043 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GhrhP16043 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GhrhP16043 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GhrhP16043 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GhrhP16043 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GhrhP16043 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GhrhP16043 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GhrhP16043 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GhrhP16043 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GhrhP16043 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GhrhP16043 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GhrhP16043 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GhrhP16043 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GhrhP16043 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GhrhP16043 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GhrhP16043 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GhrhP16043 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GhrhP16043 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GhrhP16043 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GhrhP16043 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GhrhP16043 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GhrhP16043 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GhrhP16043 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GhrhP16043 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GhrhP16043 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GhrhP16043 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GhrhP16043 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GhrhP16043 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GhrhP16043 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GhrhP16043 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GhrhP16043 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GhrhP16043 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GhrhP16043 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GhrhP16043 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GhrhP16043 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GhrhP16043 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GhrhP16043 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GhrhP16043 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GhrhP16043 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GhrhP16043 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GhrhP16043 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GhrhP16043 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GhrhP16043 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GhrhP16043 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GhrhP16043 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GhrhP16043 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GhrhP16043 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GhrhP16043 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GhrhP16043 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GhrhP16043 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GhrhP16043 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GhrhP16043 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GhrhP16043 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GhrhP16043 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GhrhP16043 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GhrhP16043 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GhrhP16043 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms