Protein–RNA interactions for Protein: P06324

T-cell receptor gamma chain V region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06324 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
P06324 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P06324 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
P06324 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
P06324 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P06324 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P06324 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P06324 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P06324 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P06324 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P06324 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P06324 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P06324 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
P06324 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
P06324 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P06324 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
P06324 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P06324 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P06324 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P06324 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
P06324 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P06324 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P06324 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P06324 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P06324 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P06324 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P06324 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
P06324 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P06324 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
P06324 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
P06324 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P06324 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
P06324 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
P06324 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
P06324 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P06324 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P06324 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P06324 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P06324 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P06324 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P06324 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P06324 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P06324 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P06324 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P06324 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P06324 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
P06324 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
P06324 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P06324 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P06324 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P06324 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
P06324 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
P06324 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P06324 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
P06324 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P06324 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P06324 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P06324 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
P06324 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P06324 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P06324 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P06324 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P06324 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
P06324 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P06324 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P06324 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P06324 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
P06324 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P06324 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
P06324 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
P06324 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P06324 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P06324 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
P06324 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P06324 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
P06324 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
P06324 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
P06324 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
P06324 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
P06324 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
P06324 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P06324 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P06324 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P06324 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
P06324 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P06324 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
P06324 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
P06324 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
P06324 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
P06324 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P06324 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P06324 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P06324 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P06324 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P06324 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
P06324 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
P06324 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P06324 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P06324 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P06324 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms