Protein–RNA interactions for Protein: O88430

Ccl22, C-C motif chemokine 22, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl22O88430 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccl22O88430 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccl22O88430 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccl22O88430 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccl22O88430 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccl22O88430 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccl22O88430 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccl22O88430 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccl22O88430 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccl22O88430 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccl22O88430 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccl22O88430 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccl22O88430 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccl22O88430 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccl22O88430 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccl22O88430 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccl22O88430 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccl22O88430 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccl22O88430 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccl22O88430 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccl22O88430 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccl22O88430 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccl22O88430 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccl22O88430 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccl22O88430 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccl22O88430 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccl22O88430 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccl22O88430 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccl22O88430 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccl22O88430 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccl22O88430 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccl22O88430 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccl22O88430 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccl22O88430 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccl22O88430 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccl22O88430 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccl22O88430 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccl22O88430 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccl22O88430 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccl22O88430 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccl22O88430 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccl22O88430 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccl22O88430 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccl22O88430 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccl22O88430 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccl22O88430 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccl22O88430 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccl22O88430 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccl22O88430 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccl22O88430 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccl22O88430 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccl22O88430 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccl22O88430 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccl22O88430 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccl22O88430 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccl22O88430 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccl22O88430 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccl22O88430 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccl22O88430 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccl22O88430 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccl22O88430 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccl22O88430 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccl22O88430 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccl22O88430 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccl22O88430 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccl22O88430 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccl22O88430 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccl22O88430 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccl22O88430 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccl22O88430 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccl22O88430 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccl22O88430 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccl22O88430 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccl22O88430 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccl22O88430 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccl22O88430 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccl22O88430 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccl22O88430 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccl22O88430 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccl22O88430 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccl22O88430 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccl22O88430 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccl22O88430 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccl22O88430 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccl22O88430 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccl22O88430 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccl22O88430 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccl22O88430 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccl22O88430 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccl22O88430 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccl22O88430 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccl22O88430 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccl22O88430 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccl22O88430 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccl22O88430 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccl22O88430 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccl22O88430 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccl22O88430 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccl22O88430 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccl22O88430 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms