Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CaluO35887 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CaluO35887 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CaluO35887 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CaluO35887 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CaluO35887 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CaluO35887 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CaluO35887 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CaluO35887 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CaluO35887 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CaluO35887 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CaluO35887 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CaluO35887 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CaluO35887 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CaluO35887 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CaluO35887 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CaluO35887 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CaluO35887 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CaluO35887 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CaluO35887 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CaluO35887 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CaluO35887 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CaluO35887 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CaluO35887 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CaluO35887 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CaluO35887 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CaluO35887 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CaluO35887 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CaluO35887 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CaluO35887 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CaluO35887 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CaluO35887 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CaluO35887 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CaluO35887 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CaluO35887 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CaluO35887 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CaluO35887 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CaluO35887 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CaluO35887 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CaluO35887 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CaluO35887 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CaluO35887 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CaluO35887 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CaluO35887 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CaluO35887 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CaluO35887 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CaluO35887 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CaluO35887 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CaluO35887 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CaluO35887 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CaluO35887 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CaluO35887 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CaluO35887 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CaluO35887 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CaluO35887 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CaluO35887 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CaluO35887 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CaluO35887 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CaluO35887 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CaluO35887 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CaluO35887 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CaluO35887 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CaluO35887 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CaluO35887 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CaluO35887 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CaluO35887 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CaluO35887 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CaluO35887 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CaluO35887 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CaluO35887 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CaluO35887 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CaluO35887 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CaluO35887 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CaluO35887 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CaluO35887 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CaluO35887 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CaluO35887 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CaluO35887 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CaluO35887 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CaluO35887 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CaluO35887 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CaluO35887 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CaluO35887 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CaluO35887 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CaluO35887 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CaluO35887 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CaluO35887 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CaluO35887 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CaluO35887 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CaluO35887 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CaluO35887 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CaluO35887 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CaluO35887 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CaluO35887 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CaluO35887 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CaluO35887 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CaluO35887 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CaluO35887 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CaluO35887 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CaluO35887 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms