Protein–RNA interactions for Protein: O35604

Npc1, Niemann-Pick C1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1O35604 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Npc1O35604 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Npc1O35604 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Npc1O35604 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Npc1O35604 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Npc1O35604 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Npc1O35604 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Npc1O35604 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Npc1O35604 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Npc1O35604 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Npc1O35604 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Npc1O35604 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Npc1O35604 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Npc1O35604 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Npc1O35604 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Npc1O35604 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Npc1O35604 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Npc1O35604 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Npc1O35604 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npc1O35604 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npc1O35604 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npc1O35604 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npc1O35604 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npc1O35604 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npc1O35604 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npc1O35604 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npc1O35604 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npc1O35604 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npc1O35604 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npc1O35604 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Npc1O35604 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npc1O35604 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npc1O35604 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npc1O35604 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Npc1O35604 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Npc1O35604 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Npc1O35604 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Npc1O35604 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Npc1O35604 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Npc1O35604 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Npc1O35604 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Npc1O35604 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Npc1O35604 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Npc1O35604 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Npc1O35604 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Npc1O35604 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Npc1O35604 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npc1O35604 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npc1O35604 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npc1O35604 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npc1O35604 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npc1O35604 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npc1O35604 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npc1O35604 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Npc1O35604 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Npc1O35604 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Npc1O35604 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Npc1O35604 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Npc1O35604 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Npc1O35604 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npc1O35604 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npc1O35604 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Npc1O35604 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npc1O35604 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npc1O35604 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Npc1O35604 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Npc1O35604 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npc1O35604 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npc1O35604 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npc1O35604 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npc1O35604 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npc1O35604 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Npc1O35604 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npc1O35604 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npc1O35604 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npc1O35604 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Npc1O35604 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npc1O35604 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Npc1O35604 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npc1O35604 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npc1O35604 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Npc1O35604 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Npc1O35604 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npc1O35604 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Npc1O35604 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Npc1O35604 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Npc1O35604 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Npc1O35604 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Npc1O35604 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Npc1O35604 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Npc1O35604 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Npc1O35604 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Npc1O35604 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Npc1O35604 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Npc1O35604 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Npc1O35604 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Npc1O35604 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Npc1O35604 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Npc1O35604 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Npc1O35604 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms