Protein–RNA interactions for Protein: O09174

Amacr, Alpha-methylacyl-CoA racemase, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmacrO09174 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AmacrO09174 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AmacrO09174 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
AmacrO09174 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AmacrO09174 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AmacrO09174 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AmacrO09174 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AmacrO09174 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AmacrO09174 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AmacrO09174 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AmacrO09174 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AmacrO09174 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AmacrO09174 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AmacrO09174 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AmacrO09174 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AmacrO09174 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
AmacrO09174 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AmacrO09174 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AmacrO09174 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AmacrO09174 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AmacrO09174 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AmacrO09174 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AmacrO09174 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AmacrO09174 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AmacrO09174 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AmacrO09174 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AmacrO09174 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AmacrO09174 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AmacrO09174 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AmacrO09174 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AmacrO09174 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AmacrO09174 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AmacrO09174 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AmacrO09174 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AmacrO09174 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AmacrO09174 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AmacrO09174 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AmacrO09174 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AmacrO09174 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AmacrO09174 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AmacrO09174 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AmacrO09174 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
AmacrO09174 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AmacrO09174 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AmacrO09174 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AmacrO09174 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AmacrO09174 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AmacrO09174 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AmacrO09174 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AmacrO09174 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AmacrO09174 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AmacrO09174 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AmacrO09174 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AmacrO09174 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AmacrO09174 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AmacrO09174 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AmacrO09174 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AmacrO09174 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AmacrO09174 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AmacrO09174 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AmacrO09174 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AmacrO09174 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AmacrO09174 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AmacrO09174 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AmacrO09174 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AmacrO09174 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AmacrO09174 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AmacrO09174 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AmacrO09174 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AmacrO09174 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AmacrO09174 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AmacrO09174 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AmacrO09174 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AmacrO09174 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AmacrO09174 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AmacrO09174 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AmacrO09174 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AmacrO09174 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AmacrO09174 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AmacrO09174 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AmacrO09174 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AmacrO09174 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AmacrO09174 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AmacrO09174 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AmacrO09174 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AmacrO09174 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AmacrO09174 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AmacrO09174 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AmacrO09174 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AmacrO09174 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AmacrO09174 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AmacrO09174 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AmacrO09174 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
AmacrO09174 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AmacrO09174 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AmacrO09174 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AmacrO09174 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AmacrO09174 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AmacrO09174 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AmacrO09174 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms