Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3239L7N2D9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3239L7N2D9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3239L7N2D9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3239L7N2D9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm3239L7N2D9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm3239L7N2D9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm3239L7N2D9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3239L7N2D9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3239L7N2D9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3239L7N2D9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3239L7N2D9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3239L7N2D9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3239L7N2D9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3239L7N2D9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3239L7N2D9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3239L7N2D9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3239L7N2D9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3239L7N2D9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3239L7N2D9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3239L7N2D9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3239L7N2D9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3239L7N2D9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3239L7N2D9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3239L7N2D9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3239L7N2D9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm3239L7N2D9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3239L7N2D9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3239L7N2D9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3239L7N2D9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3239L7N2D9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3239L7N2D9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3239L7N2D9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3239L7N2D9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3239L7N2D9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3239L7N2D9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3239L7N2D9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3239L7N2D9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3239L7N2D9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3239L7N2D9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3239L7N2D9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3239L7N2D9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3239L7N2D9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3239L7N2D9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3239L7N2D9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3239L7N2D9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3239L7N2D9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3239L7N2D9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3239L7N2D9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3239L7N2D9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3239L7N2D9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3239L7N2D9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3239L7N2D9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3239L7N2D9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm3239L7N2D9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3239L7N2D9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3239L7N2D9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3239L7N2D9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3239L7N2D9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3239L7N2D9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3239L7N2D9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3239L7N2D9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3239L7N2D9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3239L7N2D9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3239L7N2D9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3239L7N2D9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3239L7N2D9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3239L7N2D9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3239L7N2D9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3239L7N2D9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3239L7N2D9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3239L7N2D9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3239L7N2D9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3239L7N2D9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3239L7N2D9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3239L7N2D9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3239L7N2D9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3239L7N2D9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3239L7N2D9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3239L7N2D9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3239L7N2D9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3239L7N2D9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3239L7N2D9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3239L7N2D9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3239L7N2D9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3239L7N2D9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3239L7N2D9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3239L7N2D9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3239L7N2D9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3239L7N2D9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3239L7N2D9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3239L7N2D9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3239L7N2D9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3239L7N2D9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3239L7N2D9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3239L7N2D9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3239L7N2D9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3239L7N2D9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3239L7N2D9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3239L7N2D9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms