Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20939L7N243 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20939L7N243 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20939L7N243 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm20939L7N243 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm20939L7N243 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm20939L7N243 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm20939L7N243 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20939L7N243 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20939L7N243 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20939L7N243 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20939L7N243 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm20939L7N243 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm20939L7N243 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20939L7N243 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20939L7N243 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20939L7N243 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20939L7N243 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20939L7N243 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20939L7N243 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20939L7N243 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20939L7N243 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20939L7N243 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20939L7N243 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20939L7N243 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20939L7N243 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20939L7N243 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20939L7N243 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20939L7N243 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20939L7N243 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20939L7N243 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20939L7N243 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20939L7N243 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20939L7N243 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20939L7N243 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20939L7N243 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20939L7N243 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20939L7N243 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20939L7N243 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20939L7N243 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20939L7N243 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20939L7N243 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20939L7N243 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20939L7N243 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20939L7N243 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20939L7N243 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20939L7N243 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20939L7N243 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20939L7N243 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20939L7N243 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20939L7N243 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm20939L7N243 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm20939L7N243 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm20939L7N243 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm20939L7N243 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm20939L7N243 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm20939L7N243 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm20939L7N243 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm20939L7N243 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm20939L7N243 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm20939L7N243 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm20939L7N243 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm20939L7N243 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm20939L7N243 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20939L7N243 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20939L7N243 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm20939L7N243 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm20939L7N243 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm20939L7N243 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm20939L7N243 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm20939L7N243 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm20939L7N243 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm20939L7N243 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm20939L7N243 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm20939L7N243 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm20939L7N243 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm20939L7N243 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm20939L7N243 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm20939L7N243 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20939L7N243 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20939L7N243 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20939L7N243 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20939L7N243 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20939L7N243 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm20939L7N243 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm20939L7N243 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm20939L7N243 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20939L7N243 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20939L7N243 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm20939L7N243 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm20939L7N243 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm20939L7N243 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm20939L7N243 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm20939L7N243 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm20939L7N243 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm20939L7N243 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm20939L7N243 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm20939L7N243 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm20939L7N243 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm20939L7N243 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms