Protein–RNA interactions for Protein: L7N203

Vmn2r28, Vomeronasal 2, receptor 28, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r28L7N203 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn2r28L7N203 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r28L7N203 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r28L7N203 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn2r28L7N203 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r28L7N203 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r28L7N203 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r28L7N203 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn2r28L7N203 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn2r28L7N203 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r28L7N203 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r28L7N203 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r28L7N203 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r28L7N203 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r28L7N203 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r28L7N203 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r28L7N203 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn2r28L7N203 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r28L7N203 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r28L7N203 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn2r28L7N203 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn2r28L7N203 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r28L7N203 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r28L7N203 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r28L7N203 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r28L7N203 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r28L7N203 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r28L7N203 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r28L7N203 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r28L7N203 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r28L7N203 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r28L7N203 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r28L7N203 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r28L7N203 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r28L7N203 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn2r28L7N203 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r28L7N203 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r28L7N203 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r28L7N203 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r28L7N203 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn2r28L7N203 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r28L7N203 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r28L7N203 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r28L7N203 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r28L7N203 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r28L7N203 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r28L7N203 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r28L7N203 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r28L7N203 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r28L7N203 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r28L7N203 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r28L7N203 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r28L7N203 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r28L7N203 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r28L7N203 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r28L7N203 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r28L7N203 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r28L7N203 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r28L7N203 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r28L7N203 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn2r28L7N203 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r28L7N203 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r28L7N203 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r28L7N203 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r28L7N203 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn2r28L7N203 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn2r28L7N203 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn2r28L7N203 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn2r28L7N203 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn2r28L7N203 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn2r28L7N203 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn2r28L7N203 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn2r28L7N203 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn2r28L7N203 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn2r28L7N203 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn2r28L7N203 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn2r28L7N203 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn2r28L7N203 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn2r28L7N203 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn2r28L7N203 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn2r28L7N203 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn2r28L7N203 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn2r28L7N203 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn2r28L7N203 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r28L7N203 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r28L7N203 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn2r28L7N203 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r28L7N203 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r28L7N203 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn2r28L7N203 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn2r28L7N203 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn2r28L7N203 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn2r28L7N203 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn2r28L7N203 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn2r28L7N203 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn2r28L7N203 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r28L7N203 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn2r28L7N203 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r28L7N203 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn2r28L7N203 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms