Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BC024978J3QPC3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BC024978J3QPC3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BC024978J3QPC3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BC024978J3QPC3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BC024978J3QPC3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BC024978J3QPC3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BC024978J3QPC3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BC024978J3QPC3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BC024978J3QPC3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BC024978J3QPC3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BC024978J3QPC3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BC024978J3QPC3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BC024978J3QPC3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BC024978J3QPC3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BC024978J3QPC3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BC024978J3QPC3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BC024978J3QPC3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BC024978J3QPC3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BC024978J3QPC3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BC024978J3QPC3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BC024978J3QPC3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
BC024978J3QPC3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BC024978J3QPC3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BC024978J3QPC3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BC024978J3QPC3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BC024978J3QPC3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BC024978J3QPC3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BC024978J3QPC3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BC024978J3QPC3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BC024978J3QPC3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BC024978J3QPC3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BC024978J3QPC3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BC024978J3QPC3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BC024978J3QPC3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
BC024978J3QPC3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
BC024978J3QPC3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BC024978J3QPC3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BC024978J3QPC3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BC024978J3QPC3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BC024978J3QPC3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BC024978J3QPC3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BC024978J3QPC3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BC024978J3QPC3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BC024978J3QPC3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BC024978J3QPC3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BC024978J3QPC3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BC024978J3QPC3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BC024978J3QPC3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BC024978J3QPC3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BC024978J3QPC3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BC024978J3QPC3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BC024978J3QPC3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BC024978J3QPC3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BC024978J3QPC3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BC024978J3QPC3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BC024978J3QPC3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BC024978J3QPC3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BC024978J3QPC3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BC024978J3QPC3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BC024978J3QPC3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BC024978J3QPC3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BC024978J3QPC3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BC024978J3QPC3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BC024978J3QPC3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BC024978J3QPC3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BC024978J3QPC3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BC024978J3QPC3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BC024978J3QPC3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BC024978J3QPC3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BC024978J3QPC3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BC024978J3QPC3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BC024978J3QPC3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BC024978J3QPC3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BC024978J3QPC3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BC024978J3QPC3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BC024978J3QPC3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BC024978J3QPC3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BC024978J3QPC3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BC024978J3QPC3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BC024978J3QPC3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BC024978J3QPC3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BC024978J3QPC3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BC024978J3QPC3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BC024978J3QPC3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BC024978J3QPC3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BC024978J3QPC3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BC024978J3QPC3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BC024978J3QPC3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BC024978J3QPC3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BC024978J3QPC3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BC024978J3QPC3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BC024978J3QPC3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BC024978J3QPC3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BC024978J3QPC3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BC024978J3QPC3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BC024978J3QPC3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BC024978J3QPC3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BC024978J3QPC3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BC024978J3QPC3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms