Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r194J3JS27 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r194J3JS27 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r194J3JS27 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r194J3JS27 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r194J3JS27 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r194J3JS27 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r194J3JS27 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r194J3JS27 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r194J3JS27 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r194J3JS27 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r194J3JS27 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r194J3JS27 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r194J3JS27 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vmn1r194J3JS27 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r194J3JS27 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r194J3JS27 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r194J3JS27 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r194J3JS27 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r194J3JS27 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r194J3JS27 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r194J3JS27 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r194J3JS27 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r194J3JS27 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r194J3JS27 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r194J3JS27 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r194J3JS27 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r194J3JS27 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r194J3JS27 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r194J3JS27 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r194J3JS27 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r194J3JS27 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r194J3JS27 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r194J3JS27 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r194J3JS27 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r194J3JS27 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r194J3JS27 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r194J3JS27 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r194J3JS27 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r194J3JS27 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r194J3JS27 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r194J3JS27 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r194J3JS27 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r194J3JS27 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r194J3JS27 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r194J3JS27 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r194J3JS27 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r194J3JS27 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r194J3JS27 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r194J3JS27 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r194J3JS27 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r194J3JS27 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r194J3JS27 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r194J3JS27 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r194J3JS27 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r194J3JS27 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r194J3JS27 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r194J3JS27 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r194J3JS27 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r194J3JS27 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r194J3JS27 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r194J3JS27 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r194J3JS27 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r194J3JS27 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r194J3JS27 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r194J3JS27 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r194J3JS27 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r194J3JS27 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r194J3JS27 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r194J3JS27 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r194J3JS27 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r194J3JS27 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vmn1r194J3JS27 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r194J3JS27 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r194J3JS27 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r194J3JS27 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r194J3JS27 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r194J3JS27 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r194J3JS27 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r194J3JS27 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r194J3JS27 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r194J3JS27 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r194J3JS27 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r194J3JS27 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r194J3JS27 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r194J3JS27 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r194J3JS27 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r194J3JS27 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r194J3JS27 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r194J3JS27 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r194J3JS27 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r194J3JS27 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r194J3JS27 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r194J3JS27 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r194J3JS27 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r194J3JS27 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r194J3JS27 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r194J3JS27 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r194J3JS27 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r194J3JS27 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms