Protein–RNA interactions for Protein: H3BK29

Vmn2r6, Vomeronasal 2, receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r6H3BK29 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vmn2r6H3BK29 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vmn2r6H3BK29 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vmn2r6H3BK29 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vmn2r6H3BK29 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vmn2r6H3BK29 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vmn2r6H3BK29 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vmn2r6H3BK29 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vmn2r6H3BK29 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vmn2r6H3BK29 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vmn2r6H3BK29 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vmn2r6H3BK29 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vmn2r6H3BK29 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vmn2r6H3BK29 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vmn2r6H3BK29 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Vmn2r6H3BK29 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vmn2r6H3BK29 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vmn2r6H3BK29 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vmn2r6H3BK29 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vmn2r6H3BK29 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vmn2r6H3BK29 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vmn2r6H3BK29 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vmn2r6H3BK29 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vmn2r6H3BK29 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vmn2r6H3BK29 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vmn2r6H3BK29 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vmn2r6H3BK29 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vmn2r6H3BK29 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Vmn2r6H3BK29 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vmn2r6H3BK29 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vmn2r6H3BK29 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vmn2r6H3BK29 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vmn2r6H3BK29 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vmn2r6H3BK29 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vmn2r6H3BK29 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vmn2r6H3BK29 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn2r6H3BK29 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn2r6H3BK29 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vmn2r6H3BK29 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vmn2r6H3BK29 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vmn2r6H3BK29 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn2r6H3BK29 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn2r6H3BK29 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn2r6H3BK29 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn2r6H3BK29 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Vmn2r6H3BK29 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn2r6H3BK29 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vmn2r6H3BK29 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn2r6H3BK29 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn2r6H3BK29 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vmn2r6H3BK29 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vmn2r6H3BK29 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Vmn2r6H3BK29 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn2r6H3BK29 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn2r6H3BK29 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn2r6H3BK29 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn2r6H3BK29 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn2r6H3BK29 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn2r6H3BK29 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn2r6H3BK29 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn2r6H3BK29 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn2r6H3BK29 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn2r6H3BK29 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn2r6H3BK29 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn2r6H3BK29 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn2r6H3BK29 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn2r6H3BK29 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn2r6H3BK29 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn2r6H3BK29 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn2r6H3BK29 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn2r6H3BK29 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn2r6H3BK29 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn2r6H3BK29 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn2r6H3BK29 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn2r6H3BK29 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn2r6H3BK29 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Vmn2r6H3BK29 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Vmn2r6H3BK29 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn2r6H3BK29 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn2r6H3BK29 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn2r6H3BK29 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn2r6H3BK29 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn2r6H3BK29 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn2r6H3BK29 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn2r6H3BK29 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn2r6H3BK29 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn2r6H3BK29 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn2r6H3BK29 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn2r6H3BK29 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn2r6H3BK29 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn2r6H3BK29 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn2r6H3BK29 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn2r6H3BK29 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn2r6H3BK29 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn2r6H3BK29 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vmn2r6H3BK29 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn2r6H3BK29 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn2r6H3BK29 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn2r6H3BK29 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn2r6H3BK29 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms