Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
4933406M09RikG3XA12 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
4933406M09RikG3XA12 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
4933406M09RikG3XA12 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
4933406M09RikG3XA12 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
4933406M09RikG3XA12 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
4933406M09RikG3XA12 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
4933406M09RikG3XA12 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
4933406M09RikG3XA12 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
4933406M09RikG3XA12 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
4933406M09RikG3XA12 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
4933406M09RikG3XA12 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
4933406M09RikG3XA12 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
4933406M09RikG3XA12 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
4933406M09RikG3XA12 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
4933406M09RikG3XA12 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
4933406M09RikG3XA12 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
4933406M09RikG3XA12 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
4933406M09RikG3XA12 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
4933406M09RikG3XA12 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
4933406M09RikG3XA12 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
4933406M09RikG3XA12 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
4933406M09RikG3XA12 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
4933406M09RikG3XA12 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
4933406M09RikG3XA12 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
4933406M09RikG3XA12 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
4933406M09RikG3XA12 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
4933406M09RikG3XA12 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
4933406M09RikG3XA12 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
4933406M09RikG3XA12 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
4933406M09RikG3XA12 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
4933406M09RikG3XA12 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
4933406M09RikG3XA12 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
4933406M09RikG3XA12 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
4933406M09RikG3XA12 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
4933406M09RikG3XA12 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
4933406M09RikG3XA12 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
4933406M09RikG3XA12 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
4933406M09RikG3XA12 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
4933406M09RikG3XA12 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
4933406M09RikG3XA12 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
4933406M09RikG3XA12 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
4933406M09RikG3XA12 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
4933406M09RikG3XA12 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
4933406M09RikG3XA12 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
4933406M09RikG3XA12 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
4933406M09RikG3XA12 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
4933406M09RikG3XA12 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
4933406M09RikG3XA12 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
4933406M09RikG3XA12 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
4933406M09RikG3XA12 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
4933406M09RikG3XA12 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
4933406M09RikG3XA12 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
4933406M09RikG3XA12 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
4933406M09RikG3XA12 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
4933406M09RikG3XA12 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
4933406M09RikG3XA12 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
4933406M09RikG3XA12 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
4933406M09RikG3XA12 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
4933406M09RikG3XA12 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
4933406M09RikG3XA12 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
4933406M09RikG3XA12 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
4933406M09RikG3XA12 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
4933406M09RikG3XA12 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
4933406M09RikG3XA12 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
4933406M09RikG3XA12 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
4933406M09RikG3XA12 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
4933406M09RikG3XA12 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
4933406M09RikG3XA12 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
4933406M09RikG3XA12 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
4933406M09RikG3XA12 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
4933406M09RikG3XA12 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
4933406M09RikG3XA12 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
4933406M09RikG3XA12 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
4933406M09RikG3XA12 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
4933406M09RikG3XA12 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
4933406M09RikG3XA12 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
4933406M09RikG3XA12 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
4933406M09RikG3XA12 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
4933406M09RikG3XA12 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
4933406M09RikG3XA12 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
4933406M09RikG3XA12 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
4933406M09RikG3XA12 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
4933406M09RikG3XA12 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
4933406M09RikG3XA12 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
4933406M09RikG3XA12 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
4933406M09RikG3XA12 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
4933406M09RikG3XA12 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
4933406M09RikG3XA12 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
4933406M09RikG3XA12 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
4933406M09RikG3XA12 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
4933406M09RikG3XA12 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
4933406M09RikG3XA12 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
4933406M09RikG3XA12 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
4933406M09RikG3XA12 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
4933406M09RikG3XA12 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
4933406M09RikG3XA12 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
4933406M09RikG3XA12 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
4933406M09RikG3XA12 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
4933406M09RikG3XA12 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms