Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vmn1r39G3UWE6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vmn1r39G3UWE6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vmn1r39G3UWE6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vmn1r39G3UWE6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vmn1r39G3UWE6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vmn1r39G3UWE6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vmn1r39G3UWE6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vmn1r39G3UWE6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vmn1r39G3UWE6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vmn1r39G3UWE6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vmn1r39G3UWE6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vmn1r39G3UWE6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vmn1r39G3UWE6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vmn1r39G3UWE6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vmn1r39G3UWE6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vmn1r39G3UWE6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vmn1r39G3UWE6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vmn1r39G3UWE6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Vmn1r39G3UWE6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Vmn1r39G3UWE6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vmn1r39G3UWE6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vmn1r39G3UWE6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vmn1r39G3UWE6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vmn1r39G3UWE6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vmn1r39G3UWE6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Vmn1r39G3UWE6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vmn1r39G3UWE6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vmn1r39G3UWE6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vmn1r39G3UWE6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Vmn1r39G3UWE6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vmn1r39G3UWE6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vmn1r39G3UWE6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vmn1r39G3UWE6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vmn1r39G3UWE6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vmn1r39G3UWE6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vmn1r39G3UWE6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vmn1r39G3UWE6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vmn1r39G3UWE6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vmn1r39G3UWE6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vmn1r39G3UWE6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Vmn1r39G3UWE6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vmn1r39G3UWE6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vmn1r39G3UWE6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vmn1r39G3UWE6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vmn1r39G3UWE6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vmn1r39G3UWE6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Vmn1r39G3UWE6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Vmn1r39G3UWE6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vmn1r39G3UWE6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vmn1r39G3UWE6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vmn1r39G3UWE6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vmn1r39G3UWE6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vmn1r39G3UWE6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vmn1r39G3UWE6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vmn1r39G3UWE6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Vmn1r39G3UWE6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vmn1r39G3UWE6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vmn1r39G3UWE6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vmn1r39G3UWE6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vmn1r39G3UWE6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vmn1r39G3UWE6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vmn1r39G3UWE6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vmn1r39G3UWE6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vmn1r39G3UWE6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vmn1r39G3UWE6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vmn1r39G3UWE6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vmn1r39G3UWE6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vmn1r39G3UWE6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vmn1r39G3UWE6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vmn1r39G3UWE6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vmn1r39G3UWE6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vmn1r39G3UWE6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vmn1r39G3UWE6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vmn1r39G3UWE6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vmn1r39G3UWE6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vmn1r39G3UWE6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vmn1r39G3UWE6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vmn1r39G3UWE6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vmn1r39G3UWE6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vmn1r39G3UWE6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vmn1r39G3UWE6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vmn1r39G3UWE6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vmn1r39G3UWE6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vmn1r39G3UWE6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vmn1r39G3UWE6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vmn1r39G3UWE6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vmn1r39G3UWE6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vmn1r39G3UWE6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vmn1r39G3UWE6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vmn1r39G3UWE6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vmn1r39G3UWE6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vmn1r39G3UWE6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vmn1r39G3UWE6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vmn1r39G3UWE6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vmn1r39G3UWE6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vmn1r39G3UWE6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vmn1r39G3UWE6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vmn1r39G3UWE6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vmn1r39G3UWE6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms