Protein–RNA interactions for Protein: G3UW78

Cyp4f17, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 17, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f17G3UW78 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp4f17G3UW78 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp4f17G3UW78 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp4f17G3UW78 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp4f17G3UW78 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp4f17G3UW78 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp4f17G3UW78 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp4f17G3UW78 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp4f17G3UW78 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp4f17G3UW78 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp4f17G3UW78 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp4f17G3UW78 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp4f17G3UW78 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyp4f17G3UW78 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp4f17G3UW78 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp4f17G3UW78 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp4f17G3UW78 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp4f17G3UW78 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp4f17G3UW78 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp4f17G3UW78 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp4f17G3UW78 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp4f17G3UW78 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp4f17G3UW78 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp4f17G3UW78 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp4f17G3UW78 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cyp4f17G3UW78 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyp4f17G3UW78 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyp4f17G3UW78 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp4f17G3UW78 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp4f17G3UW78 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp4f17G3UW78 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp4f17G3UW78 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp4f17G3UW78 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp4f17G3UW78 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp4f17G3UW78 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyp4f17G3UW78 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyp4f17G3UW78 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyp4f17G3UW78 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyp4f17G3UW78 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp4f17G3UW78 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp4f17G3UW78 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp4f17G3UW78 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp4f17G3UW78 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp4f17G3UW78 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp4f17G3UW78 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp4f17G3UW78 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp4f17G3UW78 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp4f17G3UW78 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp4f17G3UW78 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp4f17G3UW78 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp4f17G3UW78 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp4f17G3UW78 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyp4f17G3UW78 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyp4f17G3UW78 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyp4f17G3UW78 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp4f17G3UW78 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp4f17G3UW78 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp4f17G3UW78 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp4f17G3UW78 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp4f17G3UW78 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp4f17G3UW78 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp4f17G3UW78 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp4f17G3UW78 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp4f17G3UW78 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp4f17G3UW78 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp4f17G3UW78 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp4f17G3UW78 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp4f17G3UW78 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp4f17G3UW78 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cyp4f17G3UW78 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp4f17G3UW78 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cyp4f17G3UW78 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp4f17G3UW78 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp4f17G3UW78 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp4f17G3UW78 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp4f17G3UW78 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cyp4f17G3UW78 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp4f17G3UW78 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cyp4f17G3UW78 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp4f17G3UW78 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp4f17G3UW78 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp4f17G3UW78 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp4f17G3UW78 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp4f17G3UW78 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cyp4f17G3UW78 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp4f17G3UW78 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp4f17G3UW78 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp4f17G3UW78 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp4f17G3UW78 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp4f17G3UW78 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp4f17G3UW78 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp4f17G3UW78 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp4f17G3UW78 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp4f17G3UW78 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp4f17G3UW78 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp4f17G3UW78 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp4f17G3UW78 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp4f17G3UW78 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp4f17G3UW78 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp4f17G3UW78 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms