Protein–RNA interactions for Protein: G3UW59

Ubap1l, MCG16443, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubap1lG3UW59 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ubap1lG3UW59 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ubap1lG3UW59 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ubap1lG3UW59 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Ubap1lG3UW59 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ubap1lG3UW59 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ubap1lG3UW59 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Ubap1lG3UW59 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Ubap1lG3UW59 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ubap1lG3UW59 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Ubap1lG3UW59 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ubap1lG3UW59 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ubap1lG3UW59 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Ubap1lG3UW59 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ubap1lG3UW59 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ubap1lG3UW59 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ubap1lG3UW59 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Ubap1lG3UW59 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ubap1lG3UW59 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ubap1lG3UW59 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ubap1lG3UW59 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ubap1lG3UW59 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ubap1lG3UW59 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Ubap1lG3UW59 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ubap1lG3UW59 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ubap1lG3UW59 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ubap1lG3UW59 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ubap1lG3UW59 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ubap1lG3UW59 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ubap1lG3UW59 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ubap1lG3UW59 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ubap1lG3UW59 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ubap1lG3UW59 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ubap1lG3UW59 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ubap1lG3UW59 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ubap1lG3UW59 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ubap1lG3UW59 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Ubap1lG3UW59 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ubap1lG3UW59 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ubap1lG3UW59 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ubap1lG3UW59 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ubap1lG3UW59 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ubap1lG3UW59 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Ubap1lG3UW59 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ubap1lG3UW59 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ubap1lG3UW59 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ubap1lG3UW59 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ubap1lG3UW59 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Ubap1lG3UW59 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ubap1lG3UW59 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ubap1lG3UW59 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ubap1lG3UW59 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ubap1lG3UW59 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Ubap1lG3UW59 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ubap1lG3UW59 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ubap1lG3UW59 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ubap1lG3UW59 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Ubap1lG3UW59 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ubap1lG3UW59 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ubap1lG3UW59 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Ubap1lG3UW59 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ubap1lG3UW59 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ubap1lG3UW59 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ubap1lG3UW59 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ubap1lG3UW59 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ubap1lG3UW59 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ubap1lG3UW59 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ubap1lG3UW59 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ubap1lG3UW59 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Ubap1lG3UW59 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ubap1lG3UW59 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ubap1lG3UW59 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ubap1lG3UW59 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ubap1lG3UW59 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ubap1lG3UW59 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ubap1lG3UW59 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.89
Ubap1lG3UW59 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ubap1lG3UW59 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ubap1lG3UW59 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ubap1lG3UW59 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ubap1lG3UW59 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ubap1lG3UW59 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ubap1lG3UW59 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ubap1lG3UW59 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ubap1lG3UW59 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ubap1lG3UW59 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ubap1lG3UW59 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ubap1lG3UW59 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Ubap1lG3UW59 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ubap1lG3UW59 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Ubap1lG3UW59 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Ubap1lG3UW59 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ubap1lG3UW59 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ubap1lG3UW59 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ubap1lG3UW59 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ubap1lG3UW59 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ubap1lG3UW59 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ubap1lG3UW59 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ubap1lG3UW59 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ubap1lG3UW59 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms