Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cldn34aG3UW52 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldn34aG3UW52 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldn34aG3UW52 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldn34aG3UW52 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cldn34aG3UW52 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cldn34aG3UW52 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cldn34aG3UW52 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cldn34aG3UW52 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cldn34aG3UW52 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cldn34aG3UW52 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cldn34aG3UW52 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn34aG3UW52 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn34aG3UW52 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn34aG3UW52 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldn34aG3UW52 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cldn34aG3UW52 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cldn34aG3UW52 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cldn34aG3UW52 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cldn34aG3UW52 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Cldn34aG3UW52 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldn34aG3UW52 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cldn34aG3UW52 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cldn34aG3UW52 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cldn34aG3UW52 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cldn34aG3UW52 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cldn34aG3UW52 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cldn34aG3UW52 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cldn34aG3UW52 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cldn34aG3UW52 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cldn34aG3UW52 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cldn34aG3UW52 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cldn34aG3UW52 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cldn34aG3UW52 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cldn34aG3UW52 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cldn34aG3UW52 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn34aG3UW52 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn34aG3UW52 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn34aG3UW52 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn34aG3UW52 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn34aG3UW52 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn34aG3UW52 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cldn34aG3UW52 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cldn34aG3UW52 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cldn34aG3UW52 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cldn34aG3UW52 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cldn34aG3UW52 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cldn34aG3UW52 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cldn34aG3UW52 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cldn34aG3UW52 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cldn34aG3UW52 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cldn34aG3UW52 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cldn34aG3UW52 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cldn34aG3UW52 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cldn34aG3UW52 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cldn34aG3UW52 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cldn34aG3UW52 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cldn34aG3UW52 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cldn34aG3UW52 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cldn34aG3UW52 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn34aG3UW52 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn34aG3UW52 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn34aG3UW52 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn34aG3UW52 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cldn34aG3UW52 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cldn34aG3UW52 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cldn34aG3UW52 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cldn34aG3UW52 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cldn34aG3UW52 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cldn34aG3UW52 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn34aG3UW52 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cldn34aG3UW52 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldn34aG3UW52 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cldn34aG3UW52 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cldn34aG3UW52 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cldn34aG3UW52 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldn34aG3UW52 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn34aG3UW52 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn34aG3UW52 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn34aG3UW52 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn34aG3UW52 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn34aG3UW52 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldn34aG3UW52 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldn34aG3UW52 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldn34aG3UW52 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldn34aG3UW52 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cldn34aG3UW52 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cldn34aG3UW52 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cldn34aG3UW52 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cldn34aG3UW52 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cldn34aG3UW52 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cldn34aG3UW52 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn34aG3UW52 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn34aG3UW52 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn34aG3UW52 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldn34aG3UW52 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldn34aG3UW52 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn34aG3UW52 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn34aG3UW52 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn34aG3UW52 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms