Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Taf4E9QAP7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Taf4E9QAP7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Taf4E9QAP7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Taf4E9QAP7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Taf4E9QAP7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Taf4E9QAP7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Taf4E9QAP7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Taf4E9QAP7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Taf4E9QAP7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Taf4E9QAP7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Taf4E9QAP7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Taf4E9QAP7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Taf4E9QAP7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Taf4E9QAP7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Taf4E9QAP7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Taf4E9QAP7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Taf4E9QAP7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Taf4E9QAP7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Taf4E9QAP7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Taf4E9QAP7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Taf4E9QAP7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Taf4E9QAP7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Taf4E9QAP7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Taf4E9QAP7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Taf4E9QAP7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Taf4E9QAP7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Taf4E9QAP7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Taf4E9QAP7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Taf4E9QAP7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Taf4E9QAP7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Taf4E9QAP7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Taf4E9QAP7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Taf4E9QAP7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Taf4E9QAP7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Taf4E9QAP7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Taf4E9QAP7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Taf4E9QAP7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf4E9QAP7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Taf4E9QAP7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Taf4E9QAP7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Taf4E9QAP7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Taf4E9QAP7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Taf4E9QAP7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Taf4E9QAP7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Taf4E9QAP7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Taf4E9QAP7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Taf4E9QAP7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Taf4E9QAP7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Taf4E9QAP7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Taf4E9QAP7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Taf4E9QAP7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Taf4E9QAP7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf4E9QAP7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Taf4E9QAP7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf4E9QAP7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf4E9QAP7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf4E9QAP7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Taf4E9QAP7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Taf4E9QAP7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Taf4E9QAP7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Taf4E9QAP7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf4E9QAP7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Taf4E9QAP7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Taf4E9QAP7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Taf4E9QAP7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Taf4E9QAP7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Taf4E9QAP7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Taf4E9QAP7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Taf4E9QAP7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Taf4E9QAP7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Taf4E9QAP7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Taf4E9QAP7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Taf4E9QAP7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Taf4E9QAP7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Taf4E9QAP7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Taf4E9QAP7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Taf4E9QAP7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Taf4E9QAP7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Taf4E9QAP7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Taf4E9QAP7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Taf4E9QAP7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Taf4E9QAP7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Taf4E9QAP7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Taf4E9QAP7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Taf4E9QAP7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Taf4E9QAP7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Taf4E9QAP7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Taf4E9QAP7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Taf4E9QAP7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Taf4E9QAP7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Taf4E9QAP7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Taf4E9QAP7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Taf4E9QAP7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Taf4E9QAP7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Taf4E9QAP7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Taf4E9QAP7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Taf4E9QAP7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Taf4E9QAP7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Taf4E9QAP7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms