Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

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Length 1,581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC41.53■■■■■ 4.24
Arhgef5E9Q7D5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Arhgef5E9Q7D5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Arhgef5E9Q7D5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Arhgef5E9Q7D5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
Arhgef5E9Q7D5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Arhgef5E9Q7D5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.23
Arhgef5E9Q7D5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Arhgef5E9Q7D5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Arhgef5E9Q7D5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
Arhgef5E9Q7D5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Arhgef5E9Q7D5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
Arhgef5E9Q7D5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Arhgef5E9Q7D5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Arhgef5E9Q7D5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
Arhgef5E9Q7D5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Arhgef5E9Q7D5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Arhgef5E9Q7D5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Arhgef5E9Q7D5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
Arhgef5E9Q7D5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
Arhgef5E9Q7D5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
Arhgef5E9Q7D5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
Arhgef5E9Q7D5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
Arhgef5E9Q7D5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Arhgef5E9Q7D5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Arhgef5E9Q7D5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Arhgef5E9Q7D5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Arhgef5E9Q7D5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Arhgef5E9Q7D5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Arhgef5E9Q7D5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
Arhgef5E9Q7D5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
Arhgef5E9Q7D5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Arhgef5E9Q7D5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Arhgef5E9Q7D5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Arhgef5E9Q7D5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Arhgef5E9Q7D5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Arhgef5E9Q7D5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC41.09■■■■■ 4.17
Arhgef5E9Q7D5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Arhgef5E9Q7D5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Arhgef5E9Q7D5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Arhgef5E9Q7D5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Arhgef5E9Q7D5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
Arhgef5E9Q7D5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Arhgef5E9Q7D5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Arhgef5E9Q7D5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Arhgef5E9Q7D5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
Arhgef5E9Q7D5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Arhgef5E9Q7D5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Arhgef5E9Q7D5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
Arhgef5E9Q7D5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Arhgef5E9Q7D5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
Arhgef5E9Q7D5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Arhgef5E9Q7D5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
Arhgef5E9Q7D5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Arhgef5E9Q7D5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
Arhgef5E9Q7D5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
Arhgef5E9Q7D5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Arhgef5E9Q7D5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Arhgef5E9Q7D5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
Arhgef5E9Q7D5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Arhgef5E9Q7D5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
Arhgef5E9Q7D5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
Arhgef5E9Q7D5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Arhgef5E9Q7D5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Arhgef5E9Q7D5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Arhgef5E9Q7D5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Arhgef5E9Q7D5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Arhgef5E9Q7D5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
Arhgef5E9Q7D5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Arhgef5E9Q7D5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Arhgef5E9Q7D5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC40.83■■■■■ 4.13
Arhgef5E9Q7D5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.13
Arhgef5E9Q7D5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Arhgef5E9Q7D5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Arhgef5E9Q7D5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
Arhgef5E9Q7D5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Arhgef5E9Q7D5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Arhgef5E9Q7D5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Arhgef5E9Q7D5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Arhgef5E9Q7D5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Arhgef5E9Q7D5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC40.74■■■■■ 4.11
Arhgef5E9Q7D5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Arhgef5E9Q7D5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
Arhgef5E9Q7D5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Arhgef5E9Q7D5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Arhgef5E9Q7D5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Arhgef5E9Q7D5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
Arhgef5E9Q7D5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Arhgef5E9Q7D5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Arhgef5E9Q7D5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
Arhgef5E9Q7D5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Arhgef5E9Q7D5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Arhgef5E9Q7D5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Arhgef5E9Q7D5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
Arhgef5E9Q7D5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
Arhgef5E9Q7D5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Arhgef5E9Q7D5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Arhgef5E9Q7D5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Arhgef5E9Q7D5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Arhgef5E9Q7D5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms