Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1P8

Irf2bp2, Interferon regulatory factor 2-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2bp2E9Q1P8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf2bp2E9Q1P8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irf2bp2E9Q1P8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf2bp2E9Q1P8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf2bp2E9Q1P8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf2bp2E9Q1P8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf2bp2E9Q1P8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf2bp2E9Q1P8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irf2bp2E9Q1P8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Irf2bp2E9Q1P8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irf2bp2E9Q1P8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irf2bp2E9Q1P8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf2bp2E9Q1P8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf2bp2E9Q1P8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf2bp2E9Q1P8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irf2bp2E9Q1P8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irf2bp2E9Q1P8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Irf2bp2E9Q1P8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irf2bp2E9Q1P8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irf2bp2E9Q1P8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irf2bp2E9Q1P8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irf2bp2E9Q1P8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf2bp2E9Q1P8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf2bp2E9Q1P8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf2bp2E9Q1P8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irf2bp2E9Q1P8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irf2bp2E9Q1P8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irf2bp2E9Q1P8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irf2bp2E9Q1P8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf2bp2E9Q1P8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irf2bp2E9Q1P8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf2bp2E9Q1P8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irf2bp2E9Q1P8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irf2bp2E9Q1P8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irf2bp2E9Q1P8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irf2bp2E9Q1P8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irf2bp2E9Q1P8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irf2bp2E9Q1P8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irf2bp2E9Q1P8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irf2bp2E9Q1P8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Irf2bp2E9Q1P8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irf2bp2E9Q1P8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irf2bp2E9Q1P8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irf2bp2E9Q1P8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irf2bp2E9Q1P8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irf2bp2E9Q1P8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Irf2bp2E9Q1P8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Irf2bp2E9Q1P8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irf2bp2E9Q1P8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irf2bp2E9Q1P8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irf2bp2E9Q1P8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Irf2bp2E9Q1P8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Irf2bp2E9Q1P8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irf2bp2E9Q1P8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irf2bp2E9Q1P8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irf2bp2E9Q1P8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irf2bp2E9Q1P8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Irf2bp2E9Q1P8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irf2bp2E9Q1P8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Irf2bp2E9Q1P8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irf2bp2E9Q1P8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Irf2bp2E9Q1P8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irf2bp2E9Q1P8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Irf2bp2E9Q1P8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Irf2bp2E9Q1P8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irf2bp2E9Q1P8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Irf2bp2E9Q1P8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irf2bp2E9Q1P8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irf2bp2E9Q1P8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Irf2bp2E9Q1P8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irf2bp2E9Q1P8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irf2bp2E9Q1P8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irf2bp2E9Q1P8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irf2bp2E9Q1P8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irf2bp2E9Q1P8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irf2bp2E9Q1P8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irf2bp2E9Q1P8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irf2bp2E9Q1P8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irf2bp2E9Q1P8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irf2bp2E9Q1P8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irf2bp2E9Q1P8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irf2bp2E9Q1P8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irf2bp2E9Q1P8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irf2bp2E9Q1P8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irf2bp2E9Q1P8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irf2bp2E9Q1P8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irf2bp2E9Q1P8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms