Protein–RNA interactions for Protein: E9PUS4

Zfp944, Zinc finger protein 944, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp944E9PUS4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp944E9PUS4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp944E9PUS4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp944E9PUS4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp944E9PUS4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp944E9PUS4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp944E9PUS4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp944E9PUS4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp944E9PUS4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp944E9PUS4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp944E9PUS4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp944E9PUS4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp944E9PUS4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp944E9PUS4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp944E9PUS4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp944E9PUS4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp944E9PUS4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp944E9PUS4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp944E9PUS4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp944E9PUS4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp944E9PUS4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp944E9PUS4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp944E9PUS4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp944E9PUS4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp944E9PUS4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp944E9PUS4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp944E9PUS4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp944E9PUS4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp944E9PUS4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp944E9PUS4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp944E9PUS4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp944E9PUS4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp944E9PUS4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp944E9PUS4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp944E9PUS4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp944E9PUS4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp944E9PUS4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp944E9PUS4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp944E9PUS4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp944E9PUS4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp944E9PUS4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp944E9PUS4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp944E9PUS4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp944E9PUS4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp944E9PUS4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp944E9PUS4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp944E9PUS4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp944E9PUS4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp944E9PUS4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp944E9PUS4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp944E9PUS4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp944E9PUS4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp944E9PUS4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp944E9PUS4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp944E9PUS4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp944E9PUS4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zfp944E9PUS4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp944E9PUS4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp944E9PUS4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp944E9PUS4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp944E9PUS4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp944E9PUS4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp944E9PUS4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Zfp944E9PUS4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp944E9PUS4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp944E9PUS4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp944E9PUS4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp944E9PUS4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zfp944E9PUS4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp944E9PUS4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp944E9PUS4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp944E9PUS4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp944E9PUS4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp944E9PUS4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp944E9PUS4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp944E9PUS4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp944E9PUS4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp944E9PUS4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp944E9PUS4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp944E9PUS4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp944E9PUS4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp944E9PUS4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp944E9PUS4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp944E9PUS4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp944E9PUS4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp944E9PUS4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp944E9PUS4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp944E9PUS4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp944E9PUS4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp944E9PUS4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp944E9PUS4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp944E9PUS4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp944E9PUS4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp944E9PUS4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp944E9PUS4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp944E9PUS4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp944E9PUS4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp944E9PUS4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp944E9PUS4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp944E9PUS4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 240 ms