Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5M2

Gm10110, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10110D3Z5M2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm10110D3Z5M2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Gm10110D3Z5M2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm10110D3Z5M2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm10110D3Z5M2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm10110D3Z5M2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm10110D3Z5M2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm10110D3Z5M2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm10110D3Z5M2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm10110D3Z5M2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gm10110D3Z5M2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gm10110D3Z5M2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm10110D3Z5M2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm10110D3Z5M2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm10110D3Z5M2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm10110D3Z5M2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm10110D3Z5M2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm10110D3Z5M2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm10110D3Z5M2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm10110D3Z5M2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm10110D3Z5M2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm10110D3Z5M2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm10110D3Z5M2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm10110D3Z5M2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm10110D3Z5M2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm10110D3Z5M2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm10110D3Z5M2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm10110D3Z5M2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm10110D3Z5M2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm10110D3Z5M2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm10110D3Z5M2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm10110D3Z5M2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm10110D3Z5M2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm10110D3Z5M2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm10110D3Z5M2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm10110D3Z5M2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm10110D3Z5M2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm10110D3Z5M2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm10110D3Z5M2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm10110D3Z5M2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm10110D3Z5M2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gm10110D3Z5M2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gm10110D3Z5M2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gm10110D3Z5M2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gm10110D3Z5M2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm10110D3Z5M2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm10110D3Z5M2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm10110D3Z5M2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Gm10110D3Z5M2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gm10110D3Z5M2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gm10110D3Z5M2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Gm10110D3Z5M2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gm10110D3Z5M2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gm10110D3Z5M2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm10110D3Z5M2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm10110D3Z5M2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm10110D3Z5M2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm10110D3Z5M2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm10110D3Z5M2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm10110D3Z5M2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm10110D3Z5M2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gm10110D3Z5M2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Gm10110D3Z5M2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm10110D3Z5M2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm10110D3Z5M2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm10110D3Z5M2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm10110D3Z5M2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm10110D3Z5M2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
Gm10110D3Z5M2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gm10110D3Z5M2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gm10110D3Z5M2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gm10110D3Z5M2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gm10110D3Z5M2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gm10110D3Z5M2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm10110D3Z5M2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm10110D3Z5M2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gm10110D3Z5M2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Gm10110D3Z5M2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm10110D3Z5M2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm10110D3Z5M2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm10110D3Z5M2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm10110D3Z5M2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm10110D3Z5M2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm10110D3Z5M2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gm10110D3Z5M2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm10110D3Z5M2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm10110D3Z5M2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm10110D3Z5M2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm10110D3Z5M2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm10110D3Z5M2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm10110D3Z5M2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm10110D3Z5M2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm10110D3Z5M2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm10110D3Z5M2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm10110D3Z5M2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm10110D3Z5M2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Gm10110D3Z5M2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gm10110D3Z5M2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gm10110D3Z5M2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gm10110D3Z5M2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms